Например, кишечные антибиотики нового поколения не нарушают микрофлору ЖКТ.
Российские ученые нашли новое семейство антибиотиков из группы липогликопептидов
В одном случае они использовали золото, а в другом — синий свет. Для создания новых биологически активных веществ обычно используются диазоэфиры — молекулы с азотом. Однако реакции с ними были изучены только с простыми веществами, такими как спирты и карбоновые кислоты. Чтобы получить новые соединения, которые могут стать лекарствами, включая эффективные антибиотики, нужно исследовать их реакции с более сложными «партнёрами». В одном эксперименте учёные провели реакцию между диазоэфирами и азотсодержащими кислотами, добавив катализатор на основе золота. В результате получились молекулы оксазинона, которые обладают антибактериальными свойствами.
Особую опасность CRAB представляет в медицинских учреждениях.
Наибольшему риску заражения подвергаются люди с несъемными медицинскими устройствами, например катетерами, те, кто находится в реанимации или вынужден долгое время лежать в больнице, а также те, кто восстанавливается после хирургических операций. Когда человек заражается CRAB, его крайне сложно вылечить, поэтому так необходимы новые лекарства. Среди других ярких примеров бактерий этого класса - Pseudomonas aeruginosa и всеми любимый типовой организм, старая добрая кишечная палочка. Их, как известно, трудно убить благодаря их внешней мембране, состоящей из липополисахарида ЛПС. Многие антибиотики не могут проникнуть через эту защитную оболочку, поэтому, если вы хотите справиться с грамотрицательной бактерией, вам нужно нацелиться именно на ЛПС. Зосурабалпин именно это и делает.
Подпишитесь , чтобы быть в курсе. На создание препарата киномицина ушло десять лет. Теперь команда из Гонконгского университета получила одобрение от китайского регулятора на проведение пилотных клинических исследований.
Киномицин представляет собой более совершенный тип циклического липопептидного антибиотика с новой химической структурой, сообщается на сайте университета. Что умеют программные роботы Киномицин разработан для лечения сложных инфекций кожи и мягких тканей, которые очень распространены в клинической практике и часто приводят к госпитализации и тяжелым осложнениям.
Что изменится в методах лечения? Первое и самое важное изменение: теперь документально зафиксирован запрет лечения ОРВИ антибиотиками. О том, что антибиотики не лечат вирусную инфекцию, активно говорят уже 15 лет, но в последнее время эксперты бьют тревогу: бесконтрольное употребление этих антибактериальных препаратов приводит к росту антибиотикорезистентности.
Таким образом, скоро может наступить момент, когда антибиотики перестанут помогать пациентам при бактериальных инфекциях, например, при коклюше, скарлатине и дифтерии. И, конечно, при Covid-19 эти препараты неэффективны. Вы наверняка заметили, что в последние годы антибиотики стало невозможно купить без рецепта врача. Теперь все это закреплено в стандартах лечения.
FDA одобрило новый антибиотик против инфекции мочеполовых путей
Рассказываем про самые эффективные антибиотики широкого спектра действия. крупнейший информационный. В российском представительстве Astellas подчеркивают, что с отечественного рынка уходят только эти антибиотики, другие препараты компании останутся. В эпоху стремительно распространяющейся антибиотикорезистентности ученые всеми силами пытаются найти новые антибиотики, чтобы расширить арсенал антиин. Почти все новые антибиотики и другие противомикробные лекарства, которые появились на рынке в последние десятилетия, – это лишь разновидности ранее открытых препаратов. от 7 до 14 дней.
В России создали универсальный антибиотик нового типа действия: как работает препарат
Под противопоказания также попали: миастения, тяжелые патологии почек, печени. Кроме того, средство не сочетается с одновременным приемом глюконата кальция, витаминных комплексов группы B, магния. Цена: от 700 р. Азитромицин Считается самым эффективным, поскольку имеет сразу два действия. Убивает стафилококки, стрептококки, хламидии. Также эффективен в лечение микоплазмы и уреаплазмы. Быстро всасывается, легко проходит сквозь мембранные клетки. После пяти дней регулярного применения достигается стойкий терапевтический эффект. Необходимый уровень активных веществ держится еще пять суток после окончания приема.
Азитромицином лечат: дерматоз, рожу, уретрит, ЛОР-патологии. Среди частых побочных эффектов: кандидоз, вздутие, расстройство стула. Цена: от 60 р. Амоксиклав Обладает антибактериальным действием, содержит амоксициллин и клавулановую кислоту. Имеет обширный спектр в терапии различных патологий: сальмонеллез, кокковые, мико- и коринебактериальные инфекции. Используется при смешанных инфекциях, инфицировании костно-суставной системы. Успешно применяется в области урологии и гинекологии. Цена: от 120 р.
Прием амоксиклава может вызывать диарею, развитие эритемы. Не назначается при лейкозах и мононуклеозе, поскольку имеет свойство разжижать кровь. Цефиксим Несмотря на разный состав, эффективен при тех же недугах, что и амоксиклав. Плюс его назначают для уничтожения клебсиеллы и микробов, которые вызвали патологию мочевыводящей системы. Возможные негативные последствия: головная боль, кишечное расстройство, развитие молочницы. Категорично запрещен цефиксим беременным и кормящим, а также тем, у кого присутствует повышенная чувствительность к любому из компонентов. Цена: от 520 р. Флемоксин солютаб Главное активное вещество — амоксициллин, который работает на уничтожение как грамположительных, так и грамотрицательных микробов.
Эта молекула, жонглирующая атомами, послужила идеальным ядром для нового антибиотика. К этому изменяющему форму ядру прикреплены две «боеголовки» ванкомицина, по одной на каждом конце. Авторы исследования заявили, что, по сравнению с обычным ванкомицином, препарат, меняющий форму, может иметь в своем распоряжении больше инструментов для уничтожения бактерий. Читать далее:.
Объясняется это тем, что они способны бороться с большинством возбудителей. Многочисленные исследования показали, что современные антибиотики могут нейтрализовать до двадцати различных штаммов. Другими словами, в организме запускается процесс антибиоза: один вид микроорганизмов подавляет жизнедеятельность другого. Кроме того, современные лекарства оказывают влияние не на ткани, а именно на клетки патогенной микрофлоры. По способу воздействия выделяют: Бактерицидные — попадая в организм, они нарушают процесс синтеза структурных и мембранных компонентов, в результате чего происходит гибель бактерий. Бактериостатические — действуют на угнетение развития, размножения и в целом жизнедеятельности патогенов. Ослабленные микробы уничтожаются за счет интенсивной активизации иммунной системы. В зависимости от лекарственной формы: Таблетированные — при нормальной работе ЖКТ достаточно быстро всасываются, не вызывают дискомфорта при приеме. Чаще всего назначаются взрослым людям и подросткам, начиная с 14 лет. Сиропы — прописывают, как правило, грудничкам и маленьким детям, поскольку содержат в составе ароматические добавки, нейтрализующие неприятный вкус. Дозировка — строго индивидуальна, рассчитывается врачом-педиатром. Инъекционные растворы — практически моментально всасываются, однако достаточно болезненны. Концентрация в крови достигает максимума за короткое время. Мази, капли, свечи — местно действующие лекарства оказывают своё воздействие только в конкретной области применения, не влияя на организм в целом Топ-10 эффективных антибиотиков широкого спектра действия Все они обладают мощным антибактериальным действием и помогают избавиться от большинства распространенных инфекций. Более того, их можно применять как в терапевтических целях, так и в качестве профилактики. Левомицетин Входит в группу амфениколов, эффективно воздействует на микроорганизмы, резистентные к стрептомицину и представителям пенициллинового ряда. Назначают для борьбы не только с бактериями, но и с отдельными видами вирусов. Например, с венерической лимфогранулематомой, трахомой и т. Принимается внутрь пациентами, которым диагностировали пневмонию, дизентерию, коклюш и пр. Наружно левомицетин применяют при ожогах, гнойных воспалениях, конъюнктивите. Также этим средством успешно лечат кератит — в этом случае его принимают в капельной форме. Цена: от 100 р. Категорично запрещен при беременности, лактации, болезнях крови, псориазе, прогрессирующей экземе. Кроме того, левомицетин нельзя сочетать с приемом лекарств, содержащих сульфален или стрептоцид. В ином случае возникает высокий риск наступления инсулинового шока.
Он позволяет отображать сложные многомерные данные на двух- или трехмерную плоскость, сохраняя при этом важные отношения и структуру в данных. Алгоритм t-SNE основывается на концепции близости объектов: близкие объекты в исходном пространстве имеют более высокие шансы быть близкими и после проекции на низкоразмерное пространство. Диаграмма с использованием алгоритма t-SNE t-distributed neighbor embedding показывает соединения с высокими и низкими оценками прогноза антибиотиков, а также соединения из обучающего набора данных при разных пороговых значениях оценки прогноза. Данная диаграмма позволяет визуализировать химическую схожесть или различие представленных соединений. Активные соединения из обучающего набора данных красные точки в основном разделяют соединения с высокими оценками прогнозов зеленые, черные и фиолетовые точки от соединений с низкими оценками прогнозов коричневые точки Особое замечание: как указано в t-SNE, несколько найденных веществ структурно отличаются от активных соединений в обучающем наборе, что указывает на то, что разработанные модели обобщаются на невидимые химические пространства. Обоснование прогнозов классов антибиотиков Так как графовые нейронные сети делают прогнозы на основе информации, содержащейся в атомах и связях каждой молекулы, исследователи предположили, что соединения с высокими оценками прогноза антибиотической активности содержат подструктуры «обоснования» , которые в значительной степени определяют их оценки. Выявление таких обоснований обеспечило бы гарантии объяснимости модели для интересующих нас результатов. Оценка прогноза антибиотической активности для любого найденного вещества могла бы быть прямо отнесена к его обоснованию, так, что обоснование или же рационал , рассматриваемое самостоятельно как молекулярный вход в Chemprop, сразу бы обладало высокой оценкой прогноза антибиотической активности. Возможность классификации таких обоснований сделала бы прогнозы Chemprop более понятными для людей и позволила бы последующий анализ подструктур с помощью машинного обучения. Учитывая обученные модели Chemprop, удалось вычислить такие обоснования с помощью алгоритмов поиска на основе графов. Эти алгоритмы позволили определить в контексте одной молекулы наименьшее обоснование с заданным пороговым числом атомов, имеющее положительное предсказывающее значение. Исследователи стремились найти обоснования, содержащие не менее восьми атомов и проявляющие высокие предсказательные оценки антибиотической активности, превышающие 0,1, с использованием поисковых деревьев методом Монте-Карло. Поиск методом Монте-Карло включает выбор начальной подструктуры, итеративное обрезание подструктуры и выбор удалений, приводящих к высоким оценкам предсказания, когда подграфы передаются в качестве входных данных в Chemprop. Итеративное обрезание подструктуры — это метод оптимизации моделей глубокого обучения путем последовательного удаления нейронов или связей с низкой значимостью. В начале процесса все нейроны или связи обучаются на тренировочных данных. Затем производится оценка значимости каждого нейрона или связи - например, на основе их вклада в ошибку модели или значения градиентов. После удаления происходит повторное обучение модели, чтобы компенсировать потерю ее емкости. Этот процесс повторяется, пока не достигнута желаемая эффективность модели. На рисунке показаны три возможных пути поиска от корня путем удаления периферийных связей или колец выделены оранжевым. Из-за ограничений места показаны только три шага от корня. Для предсказания активности каждого листового узла используется Chemprop, и эти предсказания используются для обновления статистики каждого промежуточного узла при обратном проходе. Этот графический поиск выводит обоснование, объясняющее пороговое значение не менее 0,1 предсказательной оценки соединения, если оно сходится; в противном случае, если обоснование не найдено, то интересующий нас случай нельзя объяснить таким образом. Как и ожидалось, многие рационалы совпали с известными фрагментами структурных классов. Однако также обнаружили обоснования, которые не были связаны ни с одним известным классом антибиотиков. Поэтому цель заключалась в лучшей фильтрации структурно новых интересных соединений и исследовании их соответствующих обоснований. Новые фильтрованные подструктуры Основываясь на выявлении известных классов антибиотиков в результате проведенных анализов, и способности графовых обоснований то же, что и рационалы предсказывать подструктуры, диагностирующие высокие показатели антибиотической активности, исследователи попытались выявить структурно новые классы антибиотиков, предсказанные обученными моделями. Чтобы рассмотреть химические структуры с благоприятными свойствами для медицинской химии, исследователи удалили все найденные подструктуры, содержащие PAINS и Brenk-предупреждения, которые относятся к подструктурам, которые могут проявлять неспецифичную реакцию, мутагенность или иметь неблагоприятную фармакокинетику. Это уменьшило количество предсказанных вариантов с 3 646 до 2 209. Далее исследователи сосредоточились на поиске соединений, не похожих на те, что были в обучающем наборе. В результате был получен окончательный набор из 1 261 совпадения, из которых 162 были из базы данных Mcule и 1 099 - из базы данных Broad Institute. Теперь все исследования будут сосредоточены вокруг этих 186 совпадений. Для того чтобы использовать эти рационалы для ясного прогнозирования структурных классов, предположили, что изучение химических основ, общих для рассматриваемых обоснований, позволит выделить наиболее значимые прогнозы структурных классов. Это особенно полезно для уменьшения объема выборки, поскольку типичные рационалы содержат большое количество атомов более 17 и отличаются друг от друга незначительными модификациями. Были вычислены химические основы с хотя бы 12 атомами, которые сохранялись во всех обоснованиях. Следует отметить, что три из пяти основ содержат хлор, что свидетельствует о том, что модели рассматривают присутствие атома хлора в этих химических контекстах как важный фактор, влияющий на антибиотическую активность.
Антибиотики нового класса получили с помощью «бактерий-убийц»
Подавить можно не только систему секреции третьего типа, но и другие системы. Важно, что такого типа лекарства, насколько мы сейчас знаем, не формируют резистентность у бактерий. Правда, это не значит, что так будет всегда, - говорит иммунолог, кандидат медицинских наук Николай Крючков. Грамотрицательные внутрибольничные инфекции очень тяжелые, часто смертельные, лечить их успешно существующими антибиотиками сложно. Это очень большая проблема, поэтому даже умеренное повышение эффективности лечения — уже неплохой результат. Это не значит, что применение препарата нельзя будет расширить, в случае успеха с завершением испытаний с урогенитальными инфекциями.
Думаю, объяснение того, почему не запустили исследования относительно других грамотрицательных инфекций простое — не хватает ресурсов, в том числе финансовых.
РАН начала работу над созданием госпрограммы по новым антибиотикам. Это должно помочь решить проблему устойчивости болезнетворных бактерий к противомикробным препаратам. Фото: 123rf. Отвечая на вопрос о проблеме резистентности устойчивости к широко используемым сегодня антибиотикам, Красников рассказал, что РАН формирует свои предложения, чтобы решить эту проблему.
На сегодняшний день существуют тысячи натуральных и синтетических веществ, которые принимаются в качестве антибиотиков. А все потому, что за сотни лет миллиарды людей не допивали курс антибиотиков и бактерии обретали к ним устойчивость. На данный момент большая часть антибиотиков совершенно бесполезна.
Но ученые постоянно занимаются разработкой новых видов. Недавно был создан тест, подсказывающий подходящий антибиотик для лечения болезни Новый антибиотик из России Недавно ученые из Тюменского государственногo унивeрситета ТюмГУ сообщили о создании нового натурального антибиотика. По их словам, он универсален и способен убивать не только бактерии, но и грибки.
Это значит, что при помощи него можно будет лечить широкий спектр различных инфекций. Антибиотик новый, а значит, у бактерий пока нет на него иммунитета. Его пока нельзя купить в аптеках, но даже после выхода в продажу он может распространяться по рецепту.
А все для того, чтобы он как можно дольше сохранял свою эффективность. Новый антибиотик получают из грибка Emericellopsis alkalina По данным научного журнала Applied Biochemistry and Microbiology , антибиотик носит название эмерициллипсин A. Его можно получить из грибов вида Emericellopsis alkalina.
Создатели антибиотика полагают, что эффективность в борьбе с патогенами и при этом более высокая безопасность в сравнении с представленными на рынке средствами сделают препараты востребованными на рынке и полезными для пациентов. У Wockhardt Bio AG остается право собственности на препараты, а «Джиэфси» займется локальными регистрационными клиническими исследованиями и получением регистраций, а также мероприятиями по маркетингу и продвижению лекарств в регионе.
Новые антибиотики группы A стрептограминов получают конструированием из блоков
Международное непатентованное наименование этих популярных препаратов — джозамицин. Их используют при инфекциях верхних и нижних дыхательных путей, стоматологических инфекциях, заболеваниях ЖКТ и многих других. В декабре запасы лекарств в аптеках практически закончились, их хватит на менее, чем на месяц. В больницах таких антибиотиков осталось на полгода, сообщает издание. Вильпрафен и вильпрафен солютаб в нашей стране выпускали заводы «Ортат» и «Зио-Здоровье».
Так каков же механизм действия гауземицинов? Почему спектр бактерий, на которые они действуют, так узок? Для ответов на эти вопросы необходимы дальнейшие исследования этих необычных антибиотиков. Гаузе и одним из первых авторов исследования, о некоторых аспектах действия гауземицинов и их возможных перспективах в клинической практике. Ведь они же могут, теоретически, нарушать целостность и внешней мембраны, что вряд ли пойдет на пользу бактериям.
По текущим данным он, как и даптомицин, реализует сложный механизм действия, требующий выполнения ряда условий. Более конкретно о мишени пока говорить рано, но для даптомицина ключевую роль играет липидный состав мембраны, весьма вероятно, для гауземицина специфичность обусловлена тем же принципом. При этом внешняя мембрана грамотрицательных бактерий сильно отличается от мембран грамположительных бактерий, в том числе и по липидному составу. Спектр активности гауземицина узок даже среди грамположительных бактерий, по всей видимости, ему не удается ни повредить внешнюю мембрану грамотрицательных бактерий, ни преодолеть ее. На текущий момент мы видим, что его спектр активности уже, чем у применяемого антибиотика. Он может представлять интерес только как отечественный аналог известного препарата, однако его внедрение требует колоссальных финансовых затрат. Гауземицин интересен в первую очередь с научной точки зрения, так как понимание механизма его действия прольет свет и на даптомицин, а также позволит с помощью химической модификации получать полусинтетические производные с оптимизированной структурой и более востребованными в современной клинической практике свойствами. Литература O. Lapchinskaya, G.
Katrukha, E. Gladkikh, V. Kulyaeva, P. Coodan, et. Investigation of the complex antibiotic INA-5812. Russ J Bioorg Chem. Tyurin, Vera A. Alferova, Alexander S.
Поэтому мы изыскиваем новые антибиотики.
Наши ученые выделили новые антибиотики из морских организмов, в том числе морских бактерий, обитающих в Японском море", - сказал Стоник. По его словам, это направление для поиска выбрано, поскольку большинство существующих антибиотиков выделены именно из бактерий. На основе полученных веществ ученые надеются наладить выпуск лекарств. Совместно с Институтом биоорганической химии им.
Результаты исследования опубликованы 12 февраля 2020 года в «Nature». Ведущий автор, PhD в области биохимии и биомедицинских наук, сотрудник Университета МакМастера Гамильтон, Канада Бет Калп поясняет: «Любая бактерия окружена клеточной оболочкой, которая придает ей форму и является источником силы.
Антибиотики, подобные пенициллину, препятствуют нормальному развитию оболочки, но открытые нами препараты действуют прямо противоположным образом, — они не дают оболочке разрушаться, что критически блокирует деление клетки. Это похоже на тюремное заключение бактерии в собственной мембране — она не сможет размножаться или расти». Изучая генетику уже известных микробов, вырабатывающих гликопептиды, ученые прежде всего обращали внимание на те гены, к которым не наблюдались эффекты резистентности, имея в виду перспективу использования таких веществ в качестве альтернативных антибиотиков. То, что мишенью и объектом действия выступает клеточная оболочка, группе удалось подтвердить с использованием визуализирующих технологий в сотрудничестве с коллективом Ива Бруна из Монреальского университета.
Трепещи, инфекция! Ученые создали принципиально новый антибиотик
Открыта новая группа антибиотиков с уникальным механизмом атакующего действия на бактерии, что делает эти препараты очень перспективными, прежде всего, в контексте. Это новый антибиотик, сделанный методом молекулярного моделирования для решения проблемы антибиотикорезистентности, работа над ним началась еще до пандемии. Российские учёные создали препарат, спасающий людей от инфекций мочевыводящих путей, даже когда бессильны самые мощные существующие антибиотики. Рассказываем, в чем особенности нового штамма «пирола», обнаруживают ли его существующие тесты и как защититься от нового варианта. Эксперты подтвердили, что найти замену вильпрафену можно, у лекарства нет преимуществ перед другими макролидными антибиотиками, включая азитромицин и кларитромицин. Одобрение же новых препаратов происходит крайне редко.
Созданы антибиотики принципиально нового действия
| Центр имени Гамалеи зарегистрировал суперантибиотик «Фтортиазинон» | Главные новости. |
| Telegram: Contact @minzdrav_ru | В новом приказе 33 наименования препаратов, среди которых: умифеновир, бромгексин, кагоцел, хлоргексидин, парацетамол, тилорон и риамиловир. |
| Ученые разработали антибиотик, преодолевающий бактериальную резистентность | Создатели антибиотика полагают, что эффективность в борьбе с патогенами и при этом более высокая безопасность в сравнении с представленными на рынке средствами сделают. |
| Скрытые гены могут быть использованы для получения новых антибиотиков | Новости | Рассказываем про самые эффективные антибиотики широкого спектра действия. |
Российские ученые создали антибиотик, активный против стойких больничных инфекций
Евросоюз одобрил новый антибиотик для лечения таких серьезных заболеваний, как пневмония и инфекции мочевыводящих путей. Международная группа ученых выделила из некультивируемой бактерии новый антибиотик с необычным механизмом действия. Главные новости. В новом приказе 33 наименования препаратов, среди которых: умифеновир, бромгексин, кагоцел, хлоргексидин, парацетамол, тилорон и риамиловир.
Фузобактериальная инфекция привела к эндометриозу яичников
Наконец, оставшиеся соединения фильтруются на предмет структурной новизны, определяемой коэффициентом сходства Танимото — менее 0,5 по отношению к любому активному соединению в обучающем наборе данных. Коэффициент Танимото является метрикой, используемой для оценки сходства между двумя множествами или наборами данных преимущественно для молекул и генов. Коэффициент Танимото вычисляется как отношение числа общих элементов между двумя наборами к общему числу элементов в обоих наборах. Он может принимать значения в диапазоне от 0 до 1, где 0 означает полное отсутствие сходства, а 1 обозначает полное совпадение. Он позволяет отображать сложные многомерные данные на двух- или трехмерную плоскость, сохраняя при этом важные отношения и структуру в данных. Алгоритм t-SNE основывается на концепции близости объектов: близкие объекты в исходном пространстве имеют более высокие шансы быть близкими и после проекции на низкоразмерное пространство.
Диаграмма с использованием алгоритма t-SNE t-distributed neighbor embedding показывает соединения с высокими и низкими оценками прогноза антибиотиков, а также соединения из обучающего набора данных при разных пороговых значениях оценки прогноза. Данная диаграмма позволяет визуализировать химическую схожесть или различие представленных соединений. Активные соединения из обучающего набора данных красные точки в основном разделяют соединения с высокими оценками прогнозов зеленые, черные и фиолетовые точки от соединений с низкими оценками прогнозов коричневые точки Особое замечание: как указано в t-SNE, несколько найденных веществ структурно отличаются от активных соединений в обучающем наборе, что указывает на то, что разработанные модели обобщаются на невидимые химические пространства. Обоснование прогнозов классов антибиотиков Так как графовые нейронные сети делают прогнозы на основе информации, содержащейся в атомах и связях каждой молекулы, исследователи предположили, что соединения с высокими оценками прогноза антибиотической активности содержат подструктуры «обоснования» , которые в значительной степени определяют их оценки. Выявление таких обоснований обеспечило бы гарантии объяснимости модели для интересующих нас результатов.
Оценка прогноза антибиотической активности для любого найденного вещества могла бы быть прямо отнесена к его обоснованию, так, что обоснование или же рационал , рассматриваемое самостоятельно как молекулярный вход в Chemprop, сразу бы обладало высокой оценкой прогноза антибиотической активности. Возможность классификации таких обоснований сделала бы прогнозы Chemprop более понятными для людей и позволила бы последующий анализ подструктур с помощью машинного обучения. Учитывая обученные модели Chemprop, удалось вычислить такие обоснования с помощью алгоритмов поиска на основе графов. Эти алгоритмы позволили определить в контексте одной молекулы наименьшее обоснование с заданным пороговым числом атомов, имеющее положительное предсказывающее значение. Исследователи стремились найти обоснования, содержащие не менее восьми атомов и проявляющие высокие предсказательные оценки антибиотической активности, превышающие 0,1, с использованием поисковых деревьев методом Монте-Карло.
Поиск методом Монте-Карло включает выбор начальной подструктуры, итеративное обрезание подструктуры и выбор удалений, приводящих к высоким оценкам предсказания, когда подграфы передаются в качестве входных данных в Chemprop. Итеративное обрезание подструктуры — это метод оптимизации моделей глубокого обучения путем последовательного удаления нейронов или связей с низкой значимостью. В начале процесса все нейроны или связи обучаются на тренировочных данных. Затем производится оценка значимости каждого нейрона или связи - например, на основе их вклада в ошибку модели или значения градиентов. После удаления происходит повторное обучение модели, чтобы компенсировать потерю ее емкости.
Этот процесс повторяется, пока не достигнута желаемая эффективность модели. На рисунке показаны три возможных пути поиска от корня путем удаления периферийных связей или колец выделены оранжевым. Из-за ограничений места показаны только три шага от корня. Для предсказания активности каждого листового узла используется Chemprop, и эти предсказания используются для обновления статистики каждого промежуточного узла при обратном проходе. Этот графический поиск выводит обоснование, объясняющее пороговое значение не менее 0,1 предсказательной оценки соединения, если оно сходится; в противном случае, если обоснование не найдено, то интересующий нас случай нельзя объяснить таким образом.
Как и ожидалось, многие рационалы совпали с известными фрагментами структурных классов. Однако также обнаружили обоснования, которые не были связаны ни с одним известным классом антибиотиков. Поэтому цель заключалась в лучшей фильтрации структурно новых интересных соединений и исследовании их соответствующих обоснований. Новые фильтрованные подструктуры Основываясь на выявлении известных классов антибиотиков в результате проведенных анализов, и способности графовых обоснований то же, что и рационалы предсказывать подструктуры, диагностирующие высокие показатели антибиотической активности, исследователи попытались выявить структурно новые классы антибиотиков, предсказанные обученными моделями. Чтобы рассмотреть химические структуры с благоприятными свойствами для медицинской химии, исследователи удалили все найденные подструктуры, содержащие PAINS и Brenk-предупреждения, которые относятся к подструктурам, которые могут проявлять неспецифичную реакцию, мутагенность или иметь неблагоприятную фармакокинетику.
Это уменьшило количество предсказанных вариантов с 3 646 до 2 209. Далее исследователи сосредоточились на поиске соединений, не похожих на те, что были в обучающем наборе. В результате был получен окончательный набор из 1 261 совпадения, из которых 162 были из базы данных Mcule и 1 099 - из базы данных Broad Institute. Теперь все исследования будут сосредоточены вокруг этих 186 совпадений.
В частности, он исключает из схемы лечения антибиотики, соответствующий документ опубликован в среду на официальном портале правовой информации. Кроме того, длительное применение антибиотиков приводит к резистентности у всей популяции — они перестают работать.
Однако часто к вирусам присоединяются бактерии — тогда антибиотики становятся актуальными.
Исследователи внесли в молекулу ариломицина несколько изменений. Во-первых, концевой углеводородный «хвост» стал короче, а прилегающую к нему аминокислотную триаду заменили остатком диаминобутановой кислоты. Также ученые защитили два фенольных гидроксила, «навесив» на каждый из них по аминоэтильной группе. Наконец, к свободной COOH-группе присоединили 2-аминоацетонитрильный заместитель.
Полученное соединение под кодовым названием G0775 эффективно подавляет, в отличие от своего естественного прототипа, большой спектр грамотрицательных бактерий. Для нового антибиотика не существует «авторитетов» среди болезнетворных микроорганизмов. К нему чувствительны все шесть особо «злостных» патогенов из группы «ESKAPE», названные так по первым буквам видовых названий. В их числе — грамотрицательные бактерии Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii и Pseudomonas aeruginosa, которых почти «не берут» существующие антибиотики ни по отдельности, ни в комбинациях. Исследователи не заметили, чтобы к новому антибиотику у бактерий вырабатывалась существенная лекарственная устойчивость.
Ученые в ответ на «бактериальную популяцию» ищут новые средства, способные утолить боль и восстановить иммунную систему человека. Специалисты Лаборатории генетики микроорганизмов Университета «Сириус» — не исключение. В новой лаборатории научного центра уже проводятся исследования по преодолению этой проблемы. При чем работа ведется сразу в нескольких направлениях.
Из некультивируемой бактерии получен новый антибиотик
Новый антибиотик получают из грибка Emericellopsis alkalina. Эффективность антибиотиков снижается из-за повышения сопротивляемости к антибиотикам у бактерий. Новый российский антибактериальный препарат широкого спектра действия Фтортиазинон поступит в оборот в июне, сообщил РИА Новости директор НИЦЭМ им. Международная фармкомпания Astellas решила вывести с российского рынка антибиотик вильпрафен, аналогов которому в России пока нет, сообщило издание РБК. |. Новый антибиотик получают из грибка Emericellopsis alkalina.
Российские ученые создали суперпатоген: все антибиотики бессильны
| Новые антибиотики группы A стрептограминов получают конструированием из блоков | МОСКВА, 20 июн – РИА Новости. |
| Российские ученые нашли новое семейство антибиотиков из группы липогликопептидов | В перспективе мы намерены использовать эти свойства нашего соединения для разработки новых антибиотиков", говорит профессор физической химии Анна Шиповская. |
| Больше никаких антибиотиков при ОРВИ: Минздрав утвердил новые стандарты лечения | Создатели антибиотика полагают, что эффективность в борьбе с патогенами и при этом более высокая безопасность в сравнении с представленными на рынке средствами сделают. |
| Фузобактериальная инфекция привела к эндометриозу яичников | Порядка сотни новых соединений может оказывать сопротивление устойчивым к уже существующим антибиотикам бактериям. |
| Евросоюз одобрил новый антибиотик для борьбы с «супербактериями» - Ведомости | Антибиотик от искусственного разума оказался эффективным против самых лекарственноустойчиых бактерий. |