Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – метод исследования кариотипа человека, позволяющий выявить хромосомные нарушения, которые связаны с изменением структуры. Слайд 74ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОКАЗАНИЯ Высокий риск ХП по результатам НИПТ. Хромосомный микроматричный анализ в диагностике причин выкидыша: анализ на 250 тяжелых генетических синдромов. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА), также известный как arrayCGH, представляет собой диагностический тест, который может обнаруживать клинически значимые крупные. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) разработан с целью выявления микроскопических и субмикроскопических вариаций числа копий генов (CNV) в геноме [9, 10].
Полногеномный хромосомный микроматричный анализ
В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА) для диагностики беременных. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – метод исследования кариотипа человека, позволяющий выявить хромосомные нарушения, которые связаны с изменением структуры. Предупредили, что в моем случае будет лучше сделать ХМА (хромосомный микроматричный анализ), но его в ЦПСиР не делают, посоветовали взять с собой на процедуру баночку. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) разработан с целью выявления микроскопических и субмикроскопических вариаций числа копий генов (CNV) в геноме [9, 10]. Слайд 74ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОКАЗАНИЯ Высокий риск ХП по результатам НИПТ.
Хромосомный микроматричный анализ при выкидыше или замершей беременности
По данным на сентябрь 2018 года в лабораторию обратились семьи с 98 детьми, среди которых было 17 девочек и 81 мальчик. Программа предусматривает анализ несколькими методами, и одна из целей исследования состоит как раз в том, чтобы оценить эффективность различных лабораторных методов для выявления генетических причин аутизма. В частности, кариотипирование, когда анализируют структурные и количественные хромосомные аномалии, не выявило ни одной причины РАС. С одной стороны, это может говорить о том, что метод в данном случае мало информативен, с другой стороны, возможно, что всё дело в особенностях выборки. На обследование не попадали дети с наиболее тяжёлыми синдромальными формами аутизма — например, когда он сопутствует синдрому Дауна, что вообще-то не редкость. Напомним, что синдром Дауна — как раз разультат масштабной хромосомной аномалии, когда у 21 хромосомы оказывается лишняя третья копия.
Поражение почек Почки содержат миллионы крошечных скоплений кровеносных сосудов, которые фильтруют отходы из крови. Диабет может повредить эту тонкую систему фильтрации. Серьезное повреждение может привести к почечной недостаточности или необратимой стадии заболевания почек, что может потребовать диализа или трансплантации почки. Слепота Диабет может повредить кровеносные сосуды сетчатки, что может привести к слепоте.
Диабет также увеличивает риск других серьезных заболеваний зрения, таких как катаракта и глаукома.
Анализ полученных данных осуществляется с помощью бесплатных и постоянно обновляемых программ: Chromosome Analysis Suite ChAS : для анализа числа копий; Multi-Sample Viewer MSV : для анализа числа копий и соматических мутаций у большого количесва образцов одновренменно; Somatic Mutation Viewer 1. Thermo FS.
Определить видовую принадлежность ДНК. Провести анализ экспрессии генов. В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды 8-80 н. Матрицы, используемые для ХМА, содержат до 6,85 млн.
Генетические анализы, проведение которых финансирует фонд для благополучателей
Поэтому секвенированием экзома называют процесс анализа всех участков ДНК, которая кодирует специфические белки, а «пустые разделы» последовательностей не исследуются. Что касается полного секвенирования генома, то во время этого метода изучается весь наследственный материал. При этом исследуются все, участки ДНК, включая и «пустые», на первый взгляд незначимые. Это исследование очень важно, потому что иногда в этих «пустых» участках могут скрываться особые мутации одного или нескольких генов, которые распределяются по всему геному, и только взгляд на весь геном дает понимание качества распределенной мутации. Можно говорить, что показание к этому исследованию — это диагностических поиск непонятных наследственных патологий, очень похожих на другие болезни, у которой нет единого источника мутации, и они находятся в разных районах генома, лежащих далеко друг от друга. Эти методы применяются, когда другие способы генетического анализа крови оказались неэффективными, в том числе, для поиска причины умственной отсталости, при аутизме, при диагностике целых групп наследственных болезней, например, нейромышечных заболеваний. ТМС или тандемная масс-спектрометрия С помощью этого высокоточного метода можно провести сразу анализ для многих десятков, и даже сотен соединений в маленьком количестве биологического материала.
По сути, при этом методе не исследуется наследственный материал, но зато можно распознать вещества, которые по своей структуре отклоняются от нормы. Речь идет в первую очередь об аминокислотах. Известно очень много наследственных заболеваний у новорождённых, при которых нарушается метаболизм белков, жиров и углеводов. В том случае, если вследствие генетического отклонения организм начинает продуцировать какое-либо дефектное, не встречающееся у нормального человека вещество, либо оно начинает накапливаться в аномально больших количествах, то можно определить, какая генетическая болезнь может этому способствует. В настоящее время этот метод используется для того, чтобы из одного анализа крови узнать о том, нет ли у новорождённого несколько десятков наследственных болезней сразу. Раньше для проведения этого метода требовалось очень много биологического материала и проведение как минимум нескольких исследований, и это понятно.
Метод тандемной масс-спектрометрии позволяет определить весь этот набор не только качественно, но и количественно, причём при сдаче одного — единственного анализа, например, генетический скрининг «пяточка» в роддоме. Можно с уверенностью диагностировать различные наследственные нарушения обмена белков, аминокислот, дефекты митохондрий, а в общей сложности — определить более 100 различных генетических заболеваний. В Российской Федерации в число обязательных и бесплатных входит пять наиболее часто встречающихся болезней. Средняя частота встречаемости заболеваний, которые определяются методом тандемной масс-спектрометрии — один случай на 5000 новорождённых малышей. Флуоресцентная гибридизация 25 С помощью этого метода современного исследования, применяемого в цитогенетике, определяют положение последовательности нуклеиновых кислоты в хромосомах в период деления клеточного ядра, а также в ядрах клеток в периоде интерфазы. Этот метод исследования используют в пренатальный и постнатальной диагностики при скринингах, а также перед применением экстракорпорального оплодотворения, для диагностики злокачественных новообразований и оценке риска их развития в следующих поколениях.
О возможных показаниях к генетическим исследованиям читайте здесь.
Такое отсутствие называется микроделецией. Почему ХМА лучше стандартного цитогенетического исследования? Хромосомный микроматричный анализ ХМА позволяет диагностировать хромосомные перестройки размером от нескольких тысяч пар оснований до 5 Мb, не видимые в стандартный цитогенетический микроскоп, которые обозначены как вариации числа копий участков ДНК CNV. Клиническое значение CNV определяется размером перестройки, количеством и составом генов, входящих в этот участок, а также ее происхождением. С учетом того, что в области CNV находится несколько генов, при их утрате или удвоении генетической информации развиваются более сложные клинические проявления. Без проведения хромосомного микроматричного анализа портретная фенотипическая, по внешним проявлениям , диагностика большинства микроделеционных и микродупликационных синдромов не представляется возможным. Для чего ещё применяется ХМА?
С помощью этого метода выявляются нарушения, которые стандартным цитогенетическим исследованием кариотипа выявить невозможно. Может быть поврежден крохотный участок в плече хромосомы и с помощью ХМА его можно зафиксиолвать несмотря на то, что повреждение может быть насколько мало, что человеческий глаз его просто не заметит. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп. Новый метод может выявить все хромосомные нарушения плода.
При выполнении этого анализа исследуются все клинически значимые участки генома и определяется избыток или недостаток генетического материала числовые аномалии, дупликации и делеции хромосом.
Это позволяет диагностировать все известные хромосомные синдромы в том числе микроделеционные и микродупликационные. Помимо вариаций числа копий ДНК, хромосомный микроматричный анализ "Стандартный" позволяет определять точечные мутации в генах, связанных с аутосомно-доминантными и аутосомно-рецессивными заболеваниями, участки отсутствия гетерозиготности, которые имеют важное значение при болезнях импринтинга, близкородственных браках, аутосомно-рецессивных заболеваниях, однородительские дисомии наличие в геноме двух хромосом от одного родителя. Особенностью "Стандартного" ХМА является возможность определять частую причину спинальной мышечной атрофии - делецию 7-8 экзонов гена SMN1 Анализ позволят установить наличие или отсутствие хромосомной патологии в случае недифференцированных синдромов у пациентов с малыми аномалиями развития, множественными врожденными пороками развития, расстройствами аутистического спектра, задержкой психомоторного развития.
Генетические нарушения у человека и методы их выявления
Многочисленные отзывы о хромосомном микроматричном анализе подтверждают его важную диагностическую ценность. В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА), позволяющий проводить. ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ (ARRAY-CGH) с использованием матрицы со средней плотностью 750 тыс. маркеров. Опубликованы Рекомендации Российского общества медицинских генетиков по хромосомному микроматричному анализу. Анализ может быть проведен даже в том случае, если беременность замерла давно и живых клеток в материале не осталось. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек организма, не видимых в обычный микроскоп.
Полногеномный хромосомный микроматричный анализ для пренатальной диагностики беременных
Если результат позитивный, то ставится диагноз Синдром Ангельмана - дефект импринтинга. Молекулярно-генетические методы, используемые для верификации диагноза и определения генетического механизма AS, представлены в таблице: Методы исследования;TДелеция 15q11. У здоровых людей метилирован материнский аллель и не метилирован отцовский аллель. У пациентов с СА, заболевание которых обусловлено de novo делецией в области 15q11-q13 материнского аллеля, отцовской дисомией 15 или дефектом импринтинга, находят только неметилированный отцовский аллель. Пациенты с мутациями гена UBE3A характеризуются нормальной структурой метилирования. Метод MS-MLPA может не только обнаруживать дефект метилирования, но и различать делеции 15q11-q13 и импринтингового центра.
Ещё одним аспектом, который может считаться осложнением, является этическая сторона проведения ХМА. Выявление генетических аномалий может вызвать эмоциональное стрессовое состояние у пациентов и их семей, особенно когда выявляются серьезные генетические нарушения. Такие результаты часто требуют обширного генетического консультирования и поддержки, чтобы помочь пациентам осознать и принять информацию о своем генетическом статусе. Необходимо подчеркнуть, что несмотря на эти потенциальные осложнения, хромосомный микроматричный анализ остается ценным инструментом для диагностики и предотвращения генетически обусловленных заболеваний.
Работа врачей и генетиков в тесном сотрудничестве с пациентами и их семьями позволяет эффективно управлять рисками и обеспечивать оптимальный результат в контексте медицинской генетики. Лечение Хромосомный микроматричный анализ ХМА сам по себе не является методом лечения, но он играет ключевую роль в области медицинской диагностики и позволяет врачам принимать более информированные решения относительно лечения и управления заболеваниями. Прежде всего, ХМА используется для выявления генетических аномалий у пациентов, таких как числовые аномалии, дупликации, делеции и несбалансированные транслокации. Диагностика генетических нарушений, особенно в случае наследственных заболеваний, предоставляет информацию, необходимую для выбора наилучших стратегий лечения и управления заболеванием. Врачи могут предоставить пациентам индивидуализированный медицинский подход, основанный на знании их генетического статуса. Это может включать в себя различные методы лечения, реабилитации и мониторинга состояния здоровья. Кроме того, ХМА широко используется в области репродуктивной медицины для оценки генетического здоровья плода во время беременности. Если выявляются серьезные генетические аномалии, родители могут быть проинформированы о возможных вариантах, таких как прерывание беременности или подготовка к особенностям будущего ухода за ребенком. Таким образом, ХМА служит важным инструментом для разработки персонализированных планов лечения и управления заболеваниями, что способствует улучшению качества медицинской помощи и решению медицинских вопросов, связанных с генетикой.
Врачи При услуге хромосомного микроматричного анализа ХМА участвует целый ряд специалистов в различных этапах процесса. Вот список врачей и специалистов, которые могут быть вовлечены: Генетик генетический консультант : Основной специалист, проводящий консультации и объясняющий пациентам результаты ХМА. Генетик может также оценивать семейный анамнез и рекомендовать необходимые меры по управлению рисками или лечению. Гинеколог при репродуктивной медицине : Участвует в сборе образцов для ХМА, особенно при анализе генетического материала плода во время беременности. Генетический лаборант: Отвечает за обработку и подготовку образцов генетического материала для анализа, амплификацию ДНК, маркировку участков и другие технические аспекты процесса. Молекулярный генетик: Специалист, интерпретирующий данные ХМА и выявляющий генетические аномалии.
Запишитесь на консультацию врача-генетика, который ответит на все Ваши вопросы и поможет определиться Преимущества В разработке. Не помещать биоматериал в формалин! НЕ замораживать! Как выглядит результат анализа Хромосомный микроматричный анализ ХМА представляет собой сложную молекулярную технологию, при которой проводится полногеномная амплификация с последующим анализом наличия множества отдельных фрагментов генома с использованием специально подготовленной микроматрицы ДНК-ЧИПа. Лицензии и сертификаты.
Эта методика позволяет в одном исследовании выявлять делеции и дупликации участков ДНК по всему геному. Разрешающая способность стандартного ХМА от 100 000 пар нуклеотидов — «букв» генетического кода в отдельных регионах от 10 000 п. С помощью ХМА можно выявлять: изменения числа хромосом; дупликации и делеции, в том числе микродупликации и микроделеции; отсутствие гетерозиготности — утрату одной из двух копий гена. Это явление имеет важное значение в онкологии, при болезнях импринтинга когда активность гена зависит от того, от какого из родителей он получен , аутосомно-рецессивных заболеваниях связанных с рецессивными генами — о них мы поговорим ниже , близкородственных браках; однородительские дисомии, когда в геноме ребенка присутствуют две хромосомы от одного родителя. Однако, как и предыдущий метод, хромосомный микроматричный анализ имеет некоторые ограничения. Он не позволяет выявлять или ограничен в выявлении таких аномалий, как: сбалансированные хромосомные аномалии, когда в хромосомах происходят изменения, которые не приводят к добавлению или утрате генетического материала. Мутации в генах и заболевания, к которым они способны приводить Мутации — это изменения, которые происходят в ДНК как случайным образом, так и под действием разных факторов, например химических веществ, ионизирующих излучений. Они могут затрагивать как отдельные «буквы» генетического кода, так и большие участки генома. Мутации происходят постоянно, и это основной двигатель эволюции. Чаще всего они бывают нейтральными, то есть ни на что не влияют, не приносят ни вреда, ни пользы. В редких случаях встречаются полезные мутации — они дают организму некоторые преимущества. Также встречаются вредные мутации — из-за них нарушается работа важных белков, наоборот, происходят достаточно часто. Все внешние признаки и особенности работы организма, которые человек получает от родителей, передаются с помощью генов. Это важнейшее свойство всех живых организмов называется наследственностью. В зависимости от того, как проявляются гены в тех или иных признаках, их делят на две большие группы. Доминантные гены. Выражаясь простым языком, эти гены более «сильные». Если в клетках присутствует хотя бы одна копия такого гена, его признаки проявятся. Рецессивные гены «слабее» доминантных. Если у человека одна копия гена доминантная и одна рецессивная, — проявится признак доминантной. А для проявления рецессивного признака нужно две соответствующих копий. Например, карий цвет глаз у человека является доминантным. Поэтому у кареглазых родителей с высокой вероятностью родится кареглазый ребенок. Если у одного из родителей глаза карие, а у другого голубые, то вероятность рождения кареглазых детей в такой семье тоже высока. У двух голубоглазых родителей, скорее всего, все дети тоже будут голубоглазыми.
Хромосомный микроматричный анализ абортивного материала (CMA of miscarriage tissue)
Хромосомный микроматричный анализ позволяет определять число копий генов SMN1 и SMN2 имеющих гомологи и трудно определяемые другими методами. Хромосомный микроматричный анализ при беременностях с распространенным видом врожденного порока сердца может быть бесполезным. "Пренатальный" хромосомный микроматричный анализ позволяет найти хромосомную патологию в связи с недифференцированными синдромами у пациентов с множественными. молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК, позволяет с максимальной точностью исключить. Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявлять анеуплоидии (количественные изменения хромосом), а также вариации числа копий ДНК, такие как делеции.
Хромосомный микроматричный анализ пренатальный в Санкт-Петербурге
Важно отметить, что хромосомный микроматричный анализ предоставляет высокоточную и подробную картину генетического кариотипа пациента, что является критическим элементом для диагностики наследственных заболеваний и принятия информированных решений в области репродуктивного здоровья. Такой интегрированный подход в медицинской генетике позволяет эффективно использовать современные технологии для предоставления ценной информации в пользу пациентов и врачей. Осложнения Хотя хромосомный микроматричный анализ ХМА является мощным инструментом для выявления генетических аномалий, процесс его проведения не лишен потенциальных осложнений. Одним из основных аспектов, который следует учитывать, является возможность получения ложноположительных или ложноотрицательных результатов. Технические аспекты анализа, такие как качество собранного образца и правильность проведения этапов подготовки и сканирования, могут влиять на достоверность результатов. Кроме того, сам процесс взятия образца генетического материала может сопровождаться рисками, особенно если применяются инвазивные методы, такие как амниоцентез или хорионическая биопсия. Эти процедуры могут быть связаны с потенциальным риском осложнений для беременной женщины, таких как инфекции или кровотечения, а также небольшим, но существующим риском потери беременности. Ещё одним аспектом, который может считаться осложнением, является этическая сторона проведения ХМА.
Выявление генетических аномалий может вызвать эмоциональное стрессовое состояние у пациентов и их семей, особенно когда выявляются серьезные генетические нарушения. Такие результаты часто требуют обширного генетического консультирования и поддержки, чтобы помочь пациентам осознать и принять информацию о своем генетическом статусе. Необходимо подчеркнуть, что несмотря на эти потенциальные осложнения, хромосомный микроматричный анализ остается ценным инструментом для диагностики и предотвращения генетически обусловленных заболеваний. Работа врачей и генетиков в тесном сотрудничестве с пациентами и их семьями позволяет эффективно управлять рисками и обеспечивать оптимальный результат в контексте медицинской генетики. Лечение Хромосомный микроматричный анализ ХМА сам по себе не является методом лечения, но он играет ключевую роль в области медицинской диагностики и позволяет врачам принимать более информированные решения относительно лечения и управления заболеваниями. Прежде всего, ХМА используется для выявления генетических аномалий у пациентов, таких как числовые аномалии, дупликации, делеции и несбалансированные транслокации. Диагностика генетических нарушений, особенно в случае наследственных заболеваний, предоставляет информацию, необходимую для выбора наилучших стратегий лечения и управления заболеванием.
Врачи могут предоставить пациентам индивидуализированный медицинский подход, основанный на знании их генетического статуса. Это может включать в себя различные методы лечения, реабилитации и мониторинга состояния здоровья. Кроме того, ХМА широко используется в области репродуктивной медицины для оценки генетического здоровья плода во время беременности. Если выявляются серьезные генетические аномалии, родители могут быть проинформированы о возможных вариантах, таких как прерывание беременности или подготовка к особенностям будущего ухода за ребенком.
Медленно заживающие язвы Частые инфекции, например, десен или кожи Чем дольше у вас диабет и чем меньше вы контролируете уровень сахара в крови, тем выше риск осложнений. В конце концов, осложнения диабета могут привести к инвалидности или даже к смерти. Возможные осложнения включают: Сердечно-сосудистые заболевания Сахар повреждает стенки сосудов и изнашивает их. Резко увеличивает риск различных сердечно-сосудистых заболеваний, включая ишемическую болезнь сердца с болью в груди, сердечный приступ, инсульт и сужение артерий. Поражение нервов Избыток сахара может повредить стенки крошечных кровеносных сосудов капилляров, которые питают нервы, особенно в ногах.
ХМА является лучшим решением для постнатальной диагностики при множественных пороках развития, задержках развития, расстройствах аутистического спектра. Он также необходим для подтверждения хромосомных аномалий, при подозрении на таковые при секвенировании нового поколения NGS. Высочайший уровень разрешения позволяет определять структурный дисбаланс на уровне экзонов для клинически релевантных генов. Пренатальная диагностика. При разрешающей способности в 800 раз превышающий классический анализ кариотипа, хромосомный микроматричный анализ обладает и такими преимуществами, как быстрота выполнения исследования из-за отсутствия необходимости культивирования материала, определение контаминации материнскими клетками и возможность определять однородительские дисомии.
Хромосомный микроматричный анализ ХМА применяется для постнатальной диагностики хромосомных аномалий, которые могут быть причиной множественных врожденных пороков и малых аномалий развития в сочетании с задержкой психомоторного развития, умственной отсталостью у ребенка, и носят название микроделеционных и микродупликационных синдромов. Что такое микроделеционный синдром? Микроделеционные синдромы — это хромосомные заболевания, которые вызваны отсутствием маленьких участков хромосом, не видимых в микроскоп при стандартном кариотипировании. Такое отсутствие называется микроделецией. Почему ХМА лучше стандартного цитогенетического исследования? Хромосомный микроматричный анализ ХМА позволяет диагностировать хромосомные перестройки размером от нескольких тысяч пар оснований до 5 Мb, не видимые в стандартный цитогенетический микроскоп, которые обозначены как вариации числа копий участков ДНК CNV. Клиническое значение CNV определяется размером перестройки, количеством и составом генов, входящих в этот участок, а также ее происхождением.
Хромосомный микроматричный анализ при неразвивающейся (замершей) беременности
молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК, позволяет с максимальной точностью исключить. оптимальный выбор для диагностики хромосомной патологии, включая трисомии, моносомии, триплоидию. Вам рекомендуется анализ кариотипа экспертного уровня обоим родителям, так как у плода выявлена несбалансированная транслокация.
Цитогенетическая лаборатория
В 2015 году в Казахстане был внедрен хромосомный микроматричный анализ (ХМА), который является золотым стандартом в постнатальной и в пренатальной диагностике. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) — метод исследования кариотипа человека, который может выявить хромосомные нарушения, связанные с изменением структуры или. Для них применили секвенирование экзома и хромосомный микроматричный анализ. Хромосомный микроматричный анализ позволяет с высокой точностью выявить заболевания аутистического спектра, причины множественных врожденных пороков развития и дать прогноз. Предупредили, что в моем случае будет лучше сделать ХМА (хромосомный микроматричный анализ), но его в ЦПСиР не делают, посоветовали взять с собой на процедуру баночку. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) -молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров.