Виды теста методом полимеразной цепной реакции: качественная, количественная и генотипирование. Как правильно сдавать анализ и расшифровка отрицательного результата ПЦР при положительных показателях ИФА. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии.
ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
ПЦР-тест на ковид – надежный метод, позволяющий определить наличие ДНК вируса в организме с первого дня инфицирования. Расшифровка результатов ПЦР исследований проводится в тот же день, когда получены результаты или в момент обращения к врачу. Точное расшифровка названия ПЦР — это полимеразная цепная реакция, которая способна выявлять даже единичные бактерии и вирусы, то есть в очень малых концентрациях. Если вируса нет, а в ПАП-тесте указано «NILM», тестирования раз в 3 года будет совершенно достаточно. Если ПЦР, экспресс-тест и IgM-антитела отрицательные, это скорее всего значит, что в последние 2-3 недели коронавируса у вас не было.
Новости Республики Коми | Комиинформ
| «Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест | Чтобы диагностировать присутствие вируса в организме, сначала появились тесты ПЦР – полимеразной цепной реакции. |
| Анализ ПЦР на гепатит В (Б): качественный и количественный. Расшифровка: норма и отклонение | Аббревиатура ПЦР обозначает полимеразная цепная реакция. |
| Антитела к коронавирусу: как правильно прочитать результаты исследований | Комиинформ | Чтобы диагностировать присутствие вируса в организме, сначала появились тесты ПЦР – полимеразной цепной реакции. |
Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт
Это особенно важно в ранней диагностике вирусного гепатита у людей, подвергшихся риску заражения, а также при контроле за противовирусной терапией. При лечении альфа-интерфероном отсутствие РНК вируса через 24 недели после завершения терапии служит критерием ее эффективности. Для чего используется исследование? Для раннего выявления вирусного гепатита С. Для дифференциальной диагностики гепатитов. Для контроля за эффективностью противовирусного лечения. Для мониторинга течения вирусного гепатита С. Для проверки донорской крови. При сомнительных результатах серологического исследования.
Но биохимия и молекулярная биология не бездействовали. Постепенно медицина убедилась, что точный диагноз можно поставить только на основании результатов вирусологического исследования. Сегодня узнать, заражен ли человек коронавирусной инфекцией, можно несколькими способами. О них и пойдет речь в этом материале. Мы разберемся, как выявить перенесенный ковид в прошлом и оценить устойчивость иммунитета к нему. Лабораторные тесты на коронавирус Covid-19 Сегодня используются разные методы диагностики коронавирусной инфекции. Одни анализы можно сдать только в лаборатории, другие — самостоятельно даже не придется вызывать врача на дом, достаточно купить специальные наборы в аптеке : ПЦР-тест. Тест на антиген. Метод экспресс-диагностики, выявляющий присутствие в биоматериале специфических белков вируса. Выявление вируса через анализ крови. Тест на антитела к коронавирусу. Первые четыре метода имеют идентичную задачу. Отличаются они сложностью проведения, затрачиваемым временем, точностью. Пятый их заменить не может. Она может делаться только в лабораторных условиях, поскольку требует изучения молекулярной структуры ДНК. Суть процедуры сводится к следующему: Берется мазок из носоглотки человека для большей точности это должен сделать медицинский работник. Выделяется интересующий участок ДНК биоматериала. Осуществляется амплификация многократное удвоение этого участка до объема, оптимального для визуализации. Изучаются визуализированные фрагменты. Если при копировании участка ДНК в нем продолжает появляться вирус, значит, пациент заражен. Получить результаты ПЦР-теста можно через несколько дней. Во время ожидания особенно при наличии симптомов лучше соблюдать самоизоляцию.
Основные аспекты указаны в памятке: За 5—7 дней отказаться от потребления жирной, жареной пищи, алкоголя. За 12—14 часов до проведения исследования не есть. Пить можно только воду. Сдать кровь лучше в первой половине дня. До процедуры не курить. Также следует предупредить доктора о принимаемых лекарственных препаратах, возможных проблемах со здоровьем, хронических заболеваниях. Забор крови выполняется из вены. После окончания процедуры место прокола медсестра заклеивает стерильным пластырем, предупреждает о необходимости согнуть руку и держать ее в таком положении 10—15 минут. В противном случае высока вероятность появления болезненной гематомы. Сколько по времени делается исследование? Сколько делается анализ, зависит от лаборатории. Средний срок выполнения колеблется в пределах 1—3 дней. Некоторые клиники предоставляют платную услугу быстрой постановки ПЦР, однако время проведения ограничивается возможностями медицинской аппаратуры. В поликлинике результаты могут передаваться врачу в течение 7—10 дней. Это связывают с большим наплывом пациентов. При этом биологический материал хранится в соответствии со всеми требованиями. Расшифровка результатов Как правило, расшифровка качественной ПЦР не представляет сложности. Но во избежание ошибочной трактовки, с полученным из лаборатории бланком следует обратиться к врачу. Варианты, что означает та или иная разновидность ПЦР, приведены в таблице. Вид исследования Возможный результат и предполагаемая расшифровка Качественная ПЦР Отрицательный: человек здоров либо концентрация вирусной РНК в крови слишком мала для детекции. Положительный: человек инфицирован Проводится, если обнаружено РНК вируса качественным методом исследования. В зависимости от того, какие результаты анализов получены, определяется уровень вирусной нагрузки Генотипирование Проводится при гепатите С, подтвержденном другими методами исследования. Анализ позволяет установить точный генотип возбудителя патологии Но нередко возникает ситуация, когда ИФА на гепатит С положительный, а ПЦР отрицательный. Расшифровать такие результаты анализов может только врач. Однако подобные данные возможны в следующих случаях: беременность; перенесенный в острой форме гепатит С; пройденный курс лечения от HCV; наличие инфекций, повышающих вероятность ложноположительного результата ИФА. Только полимеразная цепная реакция показывает точное наличие вирусной инфекции в организме. Но врачу следует точно установить причину ложноположительного результата. Качественный анализ Анализ ПЦР качественный на гепатит С подтверждает присутствие возбудителя заболевания в крови. Если РНК вируса не обнаружена, человек здоров. Но при подозрении на инфицирование рекомендуют повторно пройти исследование. Положительный результат свидетельствует об инфицировании. Но этот анализ не позволяет дифференцировать хронический гепатит С от острого, и не может показать, насколько активен патологический процесс.
Подготовка к ПЦР-анализу слюны За 24 часа до исследования по предварительному согласованию с лечащим врачом следует отказаться от терапии полости рта какими-либо лекарственными препаратами. За 3 часа до исследования рекомендуется отказаться от курения, употребления пищи и гигиены полости рта полоскание, чистка зубов, применение освежителей для рта, употребление леденцов, жевательной резинки. Подготовка к ПЦР-анализу мокроты За 2 недели до исследования по согласованию с лечащим врачом следует прекратить приём противомикробных препаратов и иммуномодуляторов. Мокроту следует собирать утром, сразу после пробуждения. Предварительно нужно почистить зубы и прополоскать рот, нельзя есть до взятия биоматериала. Важно собирать не слюну или носоглоточную слизь, а мокроту. Сделайте несколько глубоких вдохов, чтобы вызвать «мокрый» кашель. Необходимо откашлять содержимое глубоких дыхательных путей. Сплюньте мокроту в заранее подготовленный стерильный контейнер с плотно закрывающейся крышкой. Минимальный объём мокроты — 1 мл. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в день взятия биоматериала. Подготовка к соскобу из зева За 24 часа до исследования по предварительному согласованию с лечащим врачом следует отказаться от терапии полости рта какими-либо лекарственными препаратами. Подготовка к соскобу из влагалища или урогенитального тракта За 30 дней до исследования следует прекратить применение антибиотиков по согласованию с лечащим врачом.
Результаты ПЦР диагностики
Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться. HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]: описание, синонимы, методы исследования, какой биоматериал можно использовать, как правильно подготовиться, для чего используется, когда назначается, что означают результаты. Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний.
Диагностика COVID-19: обзор основных методов
| Новости Республики Коми | Комиинформ | Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) обладает высокой специфичностью при выявлении РНК SARS-CoV-2. |
| ПЦР анализ – что это такое, как делают ПЦР анализ крови. | Полимеразная цепная реакция, или ПЦР, используется для диагностики язвы желудка, колита, энтерита. |
7 вопросов про ПЦР-тест
Однако, тест на определение антител класса М может давать неспецифическую реакцию, что в ряде случаев приводит к ложноположительному результату. Полимеразная цепная реакция почти для каждого из нас стала обыденностью, даже если этот каждый никогда и слов таких не слышал. Для диагностики папилломавирусной инфекции необходимо сдать анализ на ДНК папилломавируса методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) или гибридизации. ПЦР-тест — основной метод обнаружения коронавирусной инфекции. Полимеразная цепная реакция — что это такое, какие еще заболевания выявляет, в чем преимущества и РИА Новости, 22.01.2024.
7 вопросов про ПЦР-тест
| Новости Республики Коми | Комиинформ | В больницу пациентов с COVID-19 госпитализируют, как правило, после того, как им сделали ПЦР-тест. |
| Анализ ПЦР на гепатит С | За звучной аббревиатурой ПЦР скрывается сложная и не слишком понятная для рядового пациента расшифровка — полимеразная цепная реакция. |
ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
Этот процесс называются «репликация» — многократное увеличение, дублирование искомого участка до тех пор, пока он не станет доступен для определения. Процесс репликации возможен только при наличии в пробе ДНК возбудителя. Преимущества метода ПЦР Высокая специфичность. Метод ПЦР определяет заданную последовательность нуклеотидов, присущую конкретному патогену. Исключен риск ложноположительных результатов.
Для ПЦР достаточно всего несколько молекул ДНК патогена или даже уже неактивных — разрушенных вирусных частиц, сохранивших специфические участки ДНК в достаточном количестве , чтобы он был обнаружен в ходе исследования. Скорость проведения. Лаборатория получает результат ПЦР-теста через несколько часов, клиент — уже на следующий день. Скорость диагностики имеет принципиально важное значение для своевременного лечения.
Например, при диагностике бактериальных инфекций классический посев занимает от нескольких дней, а с ПЦР-анализом пациент сможет принять меры и начать лечение уже через сутки. Для исследования подходит любой биоматериал: кровь, моча, сперма, мокрота, гной, жидкости из абсцессов и пр. Кроме этого, ПЦР применяется в самых разных областях науки и медицины, работая даже там, где другие методы бессильны. Диагностика латентных инфекций.
ПЦР-диагностика определяет возбудителя инфекции даже в инкубационном периоде и при скрытом течении заболевания. Какие есть недостатки Единственный серьезный недостаток, связанный с методом полимеразной цепной реакции, - его высокая технологичность. Исследования ПЦР требуют строжайших соблюдений правил и серьезной оснащенности лабораторного комплекса. Не каждая лаборатория может позволить себе все необходимое оборудование.
Если отслеживаете показатели в динамике, сдавайте каждый анализ при одинаковых условиях: в том же лабораторном отделении, тем же методом. Исследования для оценки эффективности лечения, как правило, проводят через 2—4 недели после приёма антибактериальных препаратов. Подготовка к ПЦР-анализу слюны За 24 часа до исследования по предварительному согласованию с лечащим врачом следует отказаться от терапии полости рта какими-либо лекарственными препаратами. За 3 часа до исследования рекомендуется отказаться от курения, употребления пищи и гигиены полости рта полоскание, чистка зубов, применение освежителей для рта, употребление леденцов, жевательной резинки. Подготовка к ПЦР-анализу мокроты За 2 недели до исследования по согласованию с лечащим врачом следует прекратить приём противомикробных препаратов и иммуномодуляторов. Мокроту следует собирать утром, сразу после пробуждения.
Предварительно нужно почистить зубы и прополоскать рот, нельзя есть до взятия биоматериала. Важно собирать не слюну или носоглоточную слизь, а мокроту. Сделайте несколько глубоких вдохов, чтобы вызвать «мокрый» кашель. Необходимо откашлять содержимое глубоких дыхательных путей. Сплюньте мокроту в заранее подготовленный стерильный контейнер с плотно закрывающейся крышкой. Минимальный объём мокроты — 1 мл.
Доставьте контейнер в лабораторное отделение в день взятия биоматериала.
Соскоб из уретры у мужчин берут не ранее, чем через 2 часа после последнего мочеиспускания. Женщинам анализ следует делать до менструации или через 2-3 дня после ее окончания.
Несоблюдение правил подготовки и прием антибиотиков влияют на достоверность исследования. Как сдать ПЦР 12? Сдать анализы на скрытые инфекции можно в частном многопрофильном диагностическом центре, государственной поликлинике, женской консультации по месту проживания.
Как берут анализ, если материалом является урогенитальный соскоб? У мужчин забор производят из уретры, у женщин — из трех участков уретры, цервикального канала и влагалища. Используют специальный одноразовый зонд.
Полученный биологический материал отправляют в лабораторию. Лаборанты используют ферменты и термостат для увеличения копий специфического участка ДНК. Количество копированных ДНК микроорганизмов возрастает в тысячи раз, обеспечивая высокую чувствительность метода.
И поэтому, имея одну цепь ДНК, в соответствии с этим правилом легко построить ее пару. Собственно, на этом и основана ПЦР. Рисунок 5.
Строение ДНК. Видео 2. Типичная реакционная смесь Анализируемая ДНК.
Это может быть как отдельный кусочек молекулы, так и плазмида, хромосома или геном клетки полностью. Для грубой оценки сойдет даже суспензия клеток. ДНК служит матрицей для многократного копирования нужного участка.
Праймер — это искусственно синтезированная короткая цепочка нуклеотидов 15—30 штук , комплементарная выбранному участку одной из цепей анализируемой ДНК. Один из праймеров обычно соответствует началу амплифицируемого отрезка, другой — его концу, но на противоположной цепи. Фермент, строящий комплементарную матричной цепь ДНК.
Обычно используют термостабильные полимеразы, изначально выделенные из термофильных бактерий и архей: Thermus aquaticus Taq-полимераза , Pyrococcus furiosus Pfu-полимераза и Pyrococcus woesei Pwo-полимераза. Первая — самая производительная, а две другие — более точные. Раствор, содержащий различные ионы для поддержания нужного рН, соли магния, необходимые для работы полимеразы, и неионный детергент Tween-20 в сочетании с BSA бычьим сывороточным альбумином для предотвращения налипания компонентов реакции на стенки пробирки.
В случае ГЦ-богатых матриц в смесь часто добавляют энхансер — ДМСО диметилсульфоксид , предотвращающий нежелательные взаимодействия между комплементарными участками матрицы. Рисунок 6. Состав смеси для ПЦР.
Соблюдение правильного соотношения — большая проблема для лабораторий, где в сутки проводят несколько тысяч ПЦР: достаточно незначительно изменить концентрацию солей магния, и результаты ПЦР будут далеки от идеала. ПЦР в режиме реального времени рекомендуется для мультиплексной ПЦР и генотипирования с применением олигонуклеотидных зондов. Материал предоставлен партнёром — компанией «Диаэм» Все компоненты смешивают в нужном объеме деионизованной воды в специальных пробирках для ПЦР и помещают в амплификатор или ПЦР-циклер рис.
Рисунок 7. Расходные материалы и оборудование для ПЦР. Видео 3.
Приготовление смеси для ПЦР. Этапы реакции Цель ПЦР — получить множество одинаковых двухцепочечных кусочков ДНК строго определенной длины обычно не более 2—3 тысяч пар нуклеотидов, т. Для этого проводят 20—30 циклов реакции.
Каждый цикл состоит из трех этапов. Денатурация Чтобы полимераза могла работать, две цепи ДНК-матрицы нужно разъединить. В таких условиях разрушаются водородные связи между азотистыми основаниями параллельных цепей.
Чтобы праймеры могли комплементарно связаться отжечься только с нужными участками, при их конструировании необходимо учитывать такую важную характеристику, как температура плавления Тm. Это расчетная температура, при которой половина праймеров присоединяется к целевому участку ДНК. Рисунок 8.
Полимеразная цепная реакция.
Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит?
Для диагностики папилломавирусной инфекции необходимо сдать анализ на ДНК папилломавируса методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) или гибридизации. Результаты ПЦР – когда готовы, расшифровка. Опытный венеролог: как быстро получить результаты анализов ПЦР. Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR) — это точный метод лабораторной диагностики, который используют для выявления возбудителей инфекционных заболеваний.