Что такое ПЦР, как работает метод ПЦР в диагностике, преимущества методики, показания, подготовка к проведению ПЦР-анализа, как проводится ПЦР-анализ, что показывают результата теста. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – наиболее информативный, точный и современный метод диагностики инфекционных заболеваний, позволяющий обнаружить возбудителя в организме пациента, даже если количество вредоносных клеток исчисляется единицами.
ПЦР анализ: что это такое?
Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция! Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело.
Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют.
Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить. Но как нам это все помогает при анализах на вирус? Вот такой милаха прогонит ПЦР за полчасика Медицинское применение.
Причем ее может быть изначально очень мало, но цепной характер реакции позволит нам ее приумножить. Но если изначально целевой ДНК в пробе нет, то и реакция не пройдет. Добавляем полимеразу и праймеры, которые сядут именно и только на определенное место в ДНК какого-то интересующего нас патогена ДНК патогена ведь сильно отличается от нашей. Запускаем реакцию и смотрим, прошла она или нет!
Если прошла - значит, пациент был заражен этим патогеном, а на нет и суда нет. Получился очень точный, быстрый и относительно дешевый метод выявления патогенов - прикиньте, раньше пока анализ на какую-нибудь бактерию высеешь на питательную среду, дождешься, чтобы оно подросло, определишь, что выросло - несколько дней пройдет. А тут готовый результат за пару часов!
Сам забор — очень прост. Берётся зондом из Ротоглотки. Способ проникновения — Неважен. Однако, большинству пациентов удобнее брать через ротовую полость. В случае не обнаружения Коронавирусной инфекции по итогам ПЦР-диагностики, по запросу, мы выдаем бланк международного образца. Можете использовать его, если планируете перелёт в ближайшее время.
Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело. Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре. Этапа всего три: 1 Денатурация. При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами. При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном. Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция! Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело. Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют. Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить. Но как нам это все помогает при анализах на вирус? Вот такой милаха прогонит ПЦР за полчасика Медицинское применение.
Как правильно подготовиться к исследованию? Не курить в течение 30 минут до исследования. Он способен размножаться в клетках крови нейтрофилах, моноцитах и макрофагах, В-лимфоцитах и вызывать криоглобулинемию, болезнь Шегрена и В-клеточные лимфопролиферативные заболевания. HCV благодаря высокой мутационной активности может избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы. Существует 6 генотипов и множество субтипов вируса, которые имеют разные значения для прогноза развития заболевания и эффективности противовирусной терапии. Основной путь передачи инфекции — через кровь препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты для татуирования, пирсинга. Вероятно заражение при половом контакте и ребенка от матери во время родов, но это случается нечасто. Острый вирусный гепатит, как правило, характеризуется бессимптомным течением и остается не выявленным в большинстве случаев. Хронический вирусный гепатит С протекает с повышением печеночных ферментов и скудным проявлением симптомов.
HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР]
Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте. Такая возможность существует при ПЦР-тесте, когда биоматериал получают с помощью соскоба эпителиальных клеток из ротоглотки. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) обладает высокой специфичностью при выявлении РНК SARS-CoV-2. Виды теста методом полимеразной цепной реакции: качественная, количественная и генотипирование. Как правильно сдавать анализ и расшифровка отрицательного результата ПЦР при положительных показателях ИФА.
ПЦР анализ: что это такое?
ПЦР-тест (Мазок) на Коронавирус. Предназначение у него одно: определить есть ли вирус COVID-19 в организме в данный момент (Real-Time PCR). Трёхбуквенный вариант — это аббревиатура названия «полимеразная цепная реакция». ПЦР-тест направлен на определение возбудителя заболевания, а не на реакцию на его проникновение со стороны организма.
Диагностика COVID-19: обзор основных методов
Медпортал 03online. Здесь Вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области. Оставайтесь с нами и будьте здоровы!
Метод ПЦР используется также для ранней и высокоточной диагностики туберкулеза. На заметку ПЦР-диагностика используется в криминалистике для определения принадлежности найденного на месте преступления биоматериала, а также в экспериментальной медицине, создании генетических паспортов, мониторинге состояния окружающей среды, анализе продуктов питания, фармакологии, ветеринарии. Преимущества ПЦР-диагностики Хотя ПЦР-диагностика и является относительно «молодым» методом, широкое распространение в медицинской практике она получила благодаря явным преимуществам перед другими способами анализа: Прямое определение возбудителя инфекции. Некоторые традиционные методы, такие как иммуноферментный анализ ИФА , выделяют только белки-маркеры, которые являются продуктом жизнедеятельности возбудителей инфекции, а потому только косвенно указывают на присутствие микроорганизмов.
Наличие специфического участка в ДНК, выявленное с помощью ПЦР, безошибочно или почти безошибочно указывает на присутствие конкретной инфекции. Высокая специфичность метода. Она обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется фрагмент ДНК, характерный только для конкретного возбудителя инфекции. Специфичность исключает возможность ложных результатов анализа, тогда как в иммунологических методах исследований ошибки вполне вероятны из-за перекрестной реакции антигенов. Высокая чувствительность. При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно.
ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы. Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется. Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов. Диагностика латентных инфекций.
ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков. У нее есть свои ограничения, но их количество настолько незначительно, что не может отрицательно повлиять на популярность и эффективность метода: Вероятность амплификации ДНК не только живого, но и погибшего микроорганизма. При проведении ПЦР-диагностики для контроля эффективности лечения необходимо соблюдать определенные требования. В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка времени 1—2 месяца , за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции в организме.
Возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК праймеров осуществляется на основе знаний о генетическом строении конкретного микроорганизма. Но теоретически такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован. Их присутствие в пробе может привести к ложноположительному результату анализа. Изменчивость микроорганизмов.
Это искусственно синтезированное соединение, в котором последовательность нуклеотидов полностью идентична конкретному участку РНК вируса, не подвергающегося мутациям и изменением в зависимости от генотипа. Определение РНК вируса гепатита С выполняется с использованием строго специфичного праймера.
Фермент, отличающийся устойчивостью и структурной стабильностью на фоне изменений температуры, необходимых для правильного протекания химической реакции. Смесь протеинов. Для построения дополнительных участков РНК необходим «строительный материал», для чего к биологическому образцу добавляют определенные соединения белковой структуры. Смесь, поддерживающая оптимальный уровень рН для обеспечения протекания полимеразной цепной реакции. При некоторых способах постановки ПЦР дополнительно используются РНК-зонды и другие внутренние контроли, используемые в качестве контрольных образцов при выявлении результатов. Сам процесс увеличения участков вирусной РНК при помощи матрицы именуют амплификацией. Реакция протекает в несколько этапов: Денатурирование.
Процесс «раскручивания» нитей РНК обеспечивается повышением температуры до определенного уровня. После снижения температуры до необходимых показателей происходит присоединение праймеров к РНК. Данная стадия возможна только при наличии в образце крови искомых вирусных частиц. Непосредственный синтез участков вирусной РНК с участием ферментов. Перечисленные циклы постановки ПЦР повторяются несколько десятков раз, что обеспечивает многократное увеличение количества участков РНК возбудителя гепатита С уровня, определяемого лабораторными способами. Перед проведением анализа образец забора крови соответствующим образом подготавливается. Содержащиеся РНК адсорбируются на буфере-носителе, затем смываются и используется для постановки полимеразной цепной реакции.
Детекция результатов проводится либо методом электрофореза горизонтального или вертикального , либо способом гибридизации. Способ расшифровки результатов реакции выбирается исходя из целей проведения исследования просто выявление РНК, либо определение ее ориентировочного количества. ПЦР — самый точный анализ крови на гепатит С Перечень предлагаемых исследований на HCV включает несколько пунктов, отличающихся по стоимости, срокам готовности и способу выполнения. Если обратиться к протоколам Всемирной организации здравоохранения ВОЗ , порядок диагностики инфекции включает несколько последовательных этапов. Для начала сдают: общий анализ крови и мочи; биохимия крови; исследование на содержание глюкозы строго натощак ; анализ на ВИЧ; флюорография; иммунограмма при подозрении на наличие аутоиммунных патологий. При отклонении показателей биохимического анализа крови от физиологической нормы пациенту назначают тест, основанный на обнаружении специфических антител, вырабатываемых при контакте вируса с кровью ИФА. Но подобный анализ крови на гепатит С имеет существенный недостаток.
Процесс синтеза антител зависит от функционирования и выработки иммунокомпетентных клеток. Индивидуальные особенности организма могут стать причиной как ложноотрицательного, так и ложноположительного ответа. Перед назначением теста ИФА врач рассказывает пациенту о возможной ошибке, что вызывает ответный вопрос: «Какой анализ крови показывает гепатит С с минимальным риском получения неверных результатов? Дальнейшая тактика действий зависит от того, что покажет исследование. В случае подтверждения диагноза, пациенту сразу же назначают гепатопротекторы, предупреждают о важности правильного питания и здорового образа жизни. Но таргетная терапия невозможна без определения уровня вирусной нагрузки и генотипа гепатита С. Некоторые лекарственные препараты могут спровоцировать обострение гепатита В.
Поэтому для исключения осложнений, дополнительно назначают анализы на HBsAg. HCV лечат только после получения отрицательного результата исследования.
Для чего используется исследование? Для раннего выявления вирусного гепатита С. Для дифференциальной диагностики гепатитов. Для контроля за эффективностью противовирусного лечения. Для мониторинга течения вирусного гепатита С. Для проверки донорской крови. При сомнительных результатах серологического исследования.
При обследовании людей из группы риска по заражению вирусным гепатитом С. Если ребенок родился от инфицированной матери.
ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
Новый коронавирус тестируется по методу полимеразной цепной реакции ПЦР. Насколько вообще его сложно производить? Но чтобы провести саму реакцию и получить результат, нужно еще специальное оборудование. Ограничения — как на любом производстве: реагенты и материалы, производственные мощности и должная культура производства — не надо объяснять, что будет, если чихнуть в пробирку, — плюс кадры. Каких объемов реально достигнуть — зависит от того, какие мощности будут задействованы: если, например, какие-то линии, которые сейчас производят ПЦР-тесты для других инфекционных заболеваний, волевым решением перебросить на SARS-CoV-2, производство возрастет. С ИФА диагностика была бы быстрее, дешевле? Или это вообще не имеет значения? За подробностями лучше обратиться к специалистам в области молекулярной диагностики. Для ПЦР-тестов характерна высокая чувствительность. В их основе лежит амплификация нуклеиновой кислоты, то есть даже при малом количестве копий в образце можно получить хороший сигнал.
Кроме того, для разработки таких тестов нужен, по большому счету, только геном вируса или часть генома... То есть для того, чтобы начать их разработку, не нужно было никаких образцов, хватило журнальной публикации и специалистов, способных быстро разработать технологию. В том и прелесть ПЦР-теста, что для него достаточно генома вируса. Зимой, как только первый геном был опубликован, специалисты во всех странах начали заказывать синтез генетического материала nCoV-19. Зная нуклеотидную последовательность генома, в лаборатории можно получить участок этого генома и дальше экспериментировать уже с ним. В частности, проверить чувствительность и специфичность теста, используя вместо клинических образцов растворы ДНК. В январе у ученых большинства стран вообще и не было другого выхода, настоящие пациенты имелись только в Китае.
Собирать кал из унитаза, пелёнок или подгузников — нельзя! Поместите 1—2 чайные ложки биоматериала в герметичный контейнер. Если нужно выполнить несколько анализов, подготовьте для каждого исследования отдельную порцию биоматериала в отдельном контейнере. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после сбора. Чтобы сохранить температуру контейнера, можно поместить его в термос с кубиком льда или в пакет с хладоэлементами. Если отслеживаете показатели в динамике, сдавайте каждый анализ при одинаковых условиях: в том же лабораторном отделении, тем же методом. Исследования для оценки эффективности лечения, как правило, проводят через 2—4 недели после приёма антибактериальных препаратов. Подготовка к ПЦР-анализу слюны За 24 часа до исследования по предварительному согласованию с лечащим врачом следует отказаться от терапии полости рта какими-либо лекарственными препаратами. За 3 часа до исследования рекомендуется отказаться от курения, употребления пищи и гигиены полости рта полоскание, чистка зубов, применение освежителей для рта, употребление леденцов, жевательной резинки. Подготовка к ПЦР-анализу мокроты За 2 недели до исследования по согласованию с лечащим врачом следует прекратить приём противомикробных препаратов и иммуномодуляторов. Мокроту следует собирать утром, сразу после пробуждения. Предварительно нужно почистить зубы и прополоскать рот, нельзя есть до взятия биоматериала. Важно собирать не слюну или носоглоточную слизь, а мокроту.
Те в свою очередь тоже заболели и так далее. А работа в три смены и количество анализов, нарастающее как снежная лавина, еще сильнее подрывают здоровье людей и их психику. Они заболевают еще быстрее, а порой просто увольняются. В результате две недели назад коммерческие лаборатории просто остановились, поскольку все стало совсем плохо", - считает Раманкулов. Директор Национального центра биотехнологии отмечает, что "летняя" пневмония в 98 процентах случаев - вирусная. Если у вас все симптомы коронавируса, а результаты теста оказались отрицательными, то это ничего не означает. Значит, плохо выделили РНК. Нужно сдавать еще раз", - говорит он. И добавляет: "Я бы посоветовал людям, которые чувствуют у себя легкую форму коронавируса, не сдавать тест. Ведь человек без хронических заболеваний перенесет все легко. Даже если вы с помощью ПЦР узнаете, что это коронавирус, что это изменит? В больницу все равно вас не примут, а если и примут, то положат в лучшем случае в коридоре. И за вами будут ухаживать загнанные медсестры, которые на вас даже внимание обращать не будут". Поэтому, говорит он, сдавать тест стоит только при симптомах. Не бойтесь ехать в лабораторию сдавать тест. Для вас уже никто не представляет опасности, так как вы уже заболели коронавирусом", - добавляет специалист. Что такое экспресс-тест?
Если при отрицательном результате подозрение на коронавирусную инфекцию сохраняются, на приеме терапевта — врач назначает повторное обследование. ПЦР-диагностика рекомендована таким категориям населения: людям, имеющим симптомы COVID-19, длительное время повышенную температуру, сухой кашель и пр. Тест на антитела к COVID-19 При вторжении в организм патогенного агента иммунная система начинает вырабатывать специфические белки-иммуноглобулины Ig , способные запомнить и нейтрализовать этот микроорганизм. Таким образом, повторная встреча с данным возбудителем будет неопасна. Организм быстро его инактивирует. IgM обнаруживаются в анализе на 7-10 день после инфицирования с 5-го дня появления клинических признаков заболевания и остаются в организме до двух месяцев. Поскольку иммуноглобулины начинают вырабатываться не с первого дня инфицирования, то и тест на антитела сначала может быть отрицательным, ведь исследование может проводиться в период, когда организм еще не успел сформировать иммунный ответ. Логично обнаружить IgM в разгар заболевания и сразу после регресса симптоматики. IgG вырабатываются позже, примерно с 21-28 дня от момента заражения, и сохраняются в организме более продолжительное время, в течение нескольких месяцев или лет.
Чувствительность определения 60 МЕ/мл — что это значит?
ПЦР-анализ, в отличие от теста на выявление антител, должен определить, присутствует ли вирус в организме прямо сейчас, или пациент перенес инфекцию в прошлом. эксперт Читайте онлайн публикации на актуальные темы на интернет-портале ПЦР-тест позволяет определить наличие вируса папилломы, а также его тип и степень угрозы для здоровья. ПЦР, или полимеразная цепная реакция, представляет собой метод обнаружения инфекций. Как расшифровать ПЦР Как работает ПЦР тест Ответы на эти и другие вопросы читайте в статье на нашем сайте. Полимеразная цепная реакция бывает двух типов.
Анализ ПЦР на гепатит С
После этого в смесь добавляется фермент ДНК-полимераза и нуклеотиды. Смесь снова нагревается до температуры 37 градусов, при которой будет происходить нужная реакция. Если искомая последовательность присутствует в материале совпадает с добавленным праймером , то нуклеотиды присоединяются к концам праймеров, и участок ДНК удваивается путем естественной репликации. Затем процесс повторяется многократно, до накопления требуемого количества фрагментов, которые удается распознать. Таким образом можно выявить даже единичный вирус или бактерию в организме, поэтому метод очень точный. Однако стоимость его высока, поскольку полученный материал нужно много раз нагреть и охладить за короткий промежуток времени. Температура в аппарате при этом контролируется до 0,1 градуса. Читайте также: «Ламизил» от грибка ногтей. Обычно тот или иной тип анализа рекомендует лечащий врач, потому что именно он оценивает полученные результаты, одновременно учитывая клинические проявления и индивидуальный анамнез пациента. Общий анализ ПЦР Анализ может быть упрощенным.
Он называется ВПЧ скрининг. В этом случае исследуется ДНК одного или сразу определенной группы штаммов, имеющих высокую онкогенность. Отдельные штаммы при этом не выделяются. Что это значит? При таком анализе будет только положительный или отрицательный результат. В бланке указывается, какие штаммы исследуются. Например, популярен анализ на выявление 14 штаммов ВПЧ с номерами 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68, а также скрининг только на два самых опасных — 16 и 18. Результат «обнаружено» в этом анализе расшифровывается как инфицирование одним из вирусов данной группы или несколькими из них, но какими именно, исследование не покажет. Таким образом, скрининг только фиксирует заражение или его отсутствие на данный момент.
Он не может показать количество вируса в организме и не может быть основанием для назначения лечения. Присутствие ДНК ВПЧ не означает, что человек болен — это лишь повод для более тщательного наблюдения в дальнейшем и повторной сдачи анализов через год — два. Возможно, через этот срок вирус покинет организм. Кроме единой строчки с перечислением номеров ВПЧ, в таблице на бланке такого анализа будет лишь еще одна строка — КВМ. Эта аббревиатура расшифровывается как «контроль взятия материала». Данный показатель нужен для того, чтобы видеть, правильно ли проведена процедура забора биоматериала, достаточно ли в нем клеток эпителия, чтобы выполнить корректную амплификацию. Если этот показатель меньше, значит, материал был взят неправильно. В полученном образце слишком мало клеток, и среди них может не оказаться пораженных вирусом. Тогда будет получен ложноотрицательный результат.
Дифференцированный анализ ПЦР В данном анализе используется генотипирование — определение специфической последовательности ДНК каждого из исследуемых штаммов в отдельности. Так можно определить, какой конкретно штамм присутствует в организме. Также выполняется оценка КВМ. Читайте также: Это тоже скрининговый метод, только расширенный, более подробный. Он фиксирует лишь факт заражения, но не определяет, стал ли конкретный вид ВПЧ провокатором заболевания. Однако вместе с цитологическим мазком, такой ПЦР-анализ повышает эффективность выявления ассоциированных с ВПЧ заболеваний половых органов. Количественный анализ ПЦР Количественный анализ диагностически более значим, чем качественный, ведь он определяет вирусную нагрузку на организм.
IgG вырабатываются позже, примерно с 21-28 дня от момента заражения, и сохраняются в организме более продолжительное время, в течение нескольких месяцев или лет. Следовательно, обнаружить их удастся только на стадии выздоровления или в более поздние сроки. По наличию и уровню IgG в крови можно судить, как о факте перенесенной инфекции в прошлом, так и определить наличие специфического иммунитета к данному возбудителю. Какой способ диагностики лучше? Учитывая, чем отличается ПЦР от антител на КОВИД, разницу в данных исследованиях, нельзя однозначно определить, какой способ диагностики является предпочтительным. При наличии контакта с заболевшим человеком или инфицированным, а также в случае наличия симптомов, укладывающихся в картину коронавируса, рекомендуется ПЦР-диагностика в клинике в Перово. Она занимает больше времени, но позволит получить достаточно достоверные данные о наличии инфекционного возбудителя в организме. Анализ окажется информативным, если заболевание проходило даже в бессимптомной форме.
У пациентов с хронической инфекцией ВГС она также часто не диагностируется, поскольку болезнь протекает бессимптомно в течение десятилетий вплоть до развития вторичных симптомов, связанных с серьезным поражением печени. Диагностика инфицирования ВГС проводится в два этапа: Для выявления лиц с вирусной инфекцией выполняется серологическое исследование на антитела к ВГС. У таких пациентов даже при отсутствии инфекции результат исследования на антитела к ВГС будет положительным Тест на наличие РНК ВГС может быть выполнен в лаборатории или с помощью простого аппарата в клинике. Новые инновационные пробы, например на коровый антиген ВГС, находятся в стадии экспериментального тестирования и позволят в будущем проводить одноэтапную диагностику активной инфекции гепатита С. В случае диагностирования хронической инфекции ВГС пациента необходимо обследовать для определения степени поражения печени фиброз и цирроз печени. Это можно сделать с помощью биопсии печени или различных неинвазивных тестов. Решение относительно методов лечения и ведения пациента принимается на основе данных о степени поражения печени. Ранняя диагностика позволяет предотвратить развитие осложнений, связанных с инфекцией, и дальнейшую передачу вируса. ВОЗ рекомендует проводить тестирование лиц в группах повышенного риска инфицирования. ВОЗ рекомендует, чтобы все взрослые имели доступ к тестированию на ВГС и имели возможность его проведения в сочетании с получением услуг по профилактике, оказанию помощи и лечению. Во всем мире хронические заболевания печени являются одной из основных причин заболеваемости и смертности среди людей, живущих с ВИЧ. Как выполняется анализ Для выявления антител к гепатиту С используется венозная кровь: Анализ удобен тем, что не требует специальной подготовки. Его сдают в утреннее время натощак. Кровь доставляется в лабораторию в чистой пробирке, после чего обрабатывается иммуноферментным методом. После образования пар «антиген — антитело» обнаруживаются те или иные иммуноглобулины. Такой анализ является первым этапом диагностики гепатита С. Ее проводят при нарушении функций печени, появлении определенных симптомов, изменении состава крови, планировании и ведении беременности, подготовке к хирургическим вмешательствам. Антитела к вирусному гепатиту С чаще всего обнаруживаются случайно. Человека этот диагноз всегда шокирует. Однако не стоит впадать в панику, в некоторых случаях анализ оказывается ложноположительным. При выявлении антител к гепатиту необходимо и начать дальнейшее обследование. Возможные показания для проведения HCV анализа Для прохождения исследования на предмет наличия гепатита С, не нужны разрешения или направления от лечащего врача, на сегодняшний день существует масса лабораторий и медицинских центров, где любой желающий может пройти HCV анализ крови. Тем не менее, существует перечень состояний, которые являются показанием к проведению данного исследования, к ним относят: Желание стать донором. Наличие в анамнезе жизни заменного переливания крови или ее компонентов. Исключение гепатита С при наличии его вторичных признаков. Выяснение эффективности лечения гепатита С. Сдавать HCV анализ крови необходимо не ранее чем через 5-6 недель после первичного предполагаемого заражения, в противном случае даже при наличии инфекции в организме, иммуноглобулины могут выработаться не в достаточном количестве и дать ложноотрицательный результат. Необходимо сдавать после двенадцатичасового перерыва в еде — прием пищи влияет на реологические характеристики плазмы. Забор проводить утром — это связано с тем, что большинство нормативных показателей рассчитывались в утренние часы, так что для снижения вероятности ложноположительного результата, необходимо следовать этому правилу. Необходимо исключить за сутки прием гормональных, антивирусных и цитостатических препаратов. Так же следует воздержаться от приема алкоголя вечером перед посещением лаборатории. Виды антител к гепатиту С Существует два основных класса антител к гепатиту С: Антитела класса IgM вырабатываются в среднем спустя 4-6 недель после инфицирования и, как правило, свидетельствуют об остром или недавно начавшемся процессе. Антитела класса IgG образуются после первых и указывают на хроническое и затяжное течение заболевания. В рутинной клинической практике чаще всего определяют суммарные антитела к гепатиту С Anti-HCV total. Они вырабатываются на структурные компоненты вируса спустя примерно месяц после его попадания в организм и сохраняются либо пожизненно, либо до тех пор, пока инфекционный агент не будет удален. В некоторых лабораториях определяют антитела не к вирусу вообще, а к отдельным его белкам: Anti-HCV core IgG — антитела, образующиеся в ответ на структурные протеины вируса. Они появляются спустя 11-12 недель после заражения. Anti-NS3 отражают острый характер процесса. Anti-NS4 указывают на длительность заболевания и, возможно, имеют определенную связь со степенью поражения печени. В практической деятельности наличие антител к белкам NS3, NS4 и NS5 определяют редко, поскольку это значительно повышает общую стоимость диагностики. Более того, в подавляющем большинстве случаев выявление суммарных антител к гепатиту С и уровня вирусной нагрузки бывает достаточно для постановки положительного результата, определения стадии заболевания и планирования лечения. Кроме того, зарегистрировано более 80 субтипов генома. К каждому из них образуются антитела. Показания для сдачи анализа Антитела в крови могут обнаруживаться через несколько месяцев после инфицирования. Поэтому человек должен пройти не менее трех тестов в следующих случаях: После незащищенного полового контакта с незнакомым партнером. Доказательств того, что гепатит С может передаваться половым путем, не найдено, однако заболевание часто обнаруживается у пациентов, ведущих беспорядочную интимную жизнь. Гепатит С диагностируют у инъекционных наркоманов. Появление антител в крови возможно после стоматологической операции, нанесения татуировок или после посещения косметолога, однако подобные случаи редки. Перед сдачей крови доноры проходят тест на анти-HCV в обязательном порядке.
Их можно представить в виде текста из четырех букв, в котором записана информация о строении всего организма, вся наследственная информация. Этот текст, помимо всего прочего, хранит последовательность белков, которые впоследствии организм синтезирует. По изменениям в ДНК мы можем предсказать изменения в белке и, в конечном счете, в организме. Кроме того, существуют еще регуляторные участки и так называемая «мусорная ДНК», функции которых сегодня до конца неизвестны. Существуют специальные системы репарации ДНК. Когда ДНК удваивается, то по принципу комплиментарности напротив одного азотистого основания обязательно ставится другое. Это соответствие иногда может нарушаться по разным причинам. Из-за гигантской длины ДНК вероятность ошибки на трех миллиардах букв при копировании достаточно высокая. В результате большая часть мутаций ДНК исправляется специальными белками, специальными «машинками» внутри клетки. Для каждого вида нарушений существует свой фермент, который эти мутации исправляет. Информация об устройстве этих ферментов также закодирована в ДНК. К примеру, стресс может спровоцировать рак? Но все-таки статистически ДНК от внутренних причин повреждается больше. Достоверных хороших исследований на тему связи стресса и мутации ДНК нет. Если, гипотетически, представить механизм связи стресса и рака, то его следует искать на более высоком уровне, например, в изменениях иммунного ответа на клетки, в которых накопленные повреждения уже нельзя исправить. Такие клетки иммунная система должна уничтожать. От поколения к поколению насчитывается всего несколько сотен мутаций на более чем шесть миллиардов букв.
Диагностика COVID-19: обзор основных методов
Ошибка работы диагностического центра — лаборатории. Иногда нарушаются правила проведения исследования, неверно подготавливаются образцы. Исследуемый образец загрязнен. Определение в крови гепарина — вещества, которое препятствует свертыванию крови. Определение в крови ингибиторов — веществ, задерживающих физико-химические процессы. Применение различных способов и реактивов в разных лабораториях. Лучше проводить исследование в современной, хорошо себя зарекомендовавшей лаборатории. Для получения правильного результата важна чувствительность системы диагностики. Это нужно для пациентов с невысокой вирусной нагрузкой.
Частота проведения количественного анализа Сдача анализов на гепатит с расшифровкой — надежный современный способ диагностики.
Она обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется фрагмент ДНК, характерный только для конкретного возбудителя инфекции. Специфичность исключает возможность ложных результатов анализа, тогда как в иммунологических методах исследований ошибки вполне вероятны из-за перекрестной реакции антигенов. Высокая чувствительность. При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно.
ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы. Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется. Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов.
Диагностика латентных инфекций. ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков. У нее есть свои ограничения, но их количество настолько незначительно, что не может отрицательно повлиять на популярность и эффективность метода: Вероятность амплификации ДНК не только живого, но и погибшего микроорганизма.
При проведении ПЦР-диагностики для контроля эффективности лечения необходимо соблюдать определенные требования. В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка времени 1—2 месяца , за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции в организме. Возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК праймеров осуществляется на основе знаний о генетическом строении конкретного микроорганизма. Но теоретически такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован.
Их присутствие в пробе может привести к ложноположительному результату анализа. Изменчивость микроорганизмов. Эта способность возбудителей к мутации иногда приводит к тому, что некоторые их штаммы становятся неуловимыми в процессе ПЦР-анализа. Чтобы уменьшить риски, разработаны стандарты объемов испытаний тест-систем ПЦР-диагностики, включающие проверку на перекрестные реакции и тестирование всех известных штаммов конкретного возбудителя. Забор биоматериала.
Процедура, предшествующая непосредственному анализу, которая осуществляется в процедурном кабинете соответствующего профиля. Забор делается с помощью стерильного оборудования только в стерильные пробирки. Материалом для исследования могут быть: Эпителиальные соскобы со слизистых оболочек: из уретры, из цервикального канала, со слизистой дыхательных путей и зева, из конъюнктивы.
Потому что когда его мало, то труднее ставить эксперименты - проще запороть, загрязнить чем-то чужеродным и т. И тогда в далеком 1983м один любящий галлюциногены ученый Кэри Муллис решил использовать для этого то, что давно уже придумала природа - репликацию, только искусственную, в пробирке. Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело.
Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре. Этапа всего три: 1 Денатурация. При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами. При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном. Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз. В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две!
Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция! Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело. Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют.
Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить.
Какую роль играет чувствительность при диагностике заболевания и выборе подходящей терапии?
Кто должен сдавать ПЦР, и как к нему подготовиться? Ответы на эти вопросы вы сможете найти в нашей статье. Расшифровывается данная аббревиатура как «полимеразная цепная реакция».
Этот тест широко используется для диагностики гепатита С благодаря своей высокой реактивной восприимчивостью. Полимеразная цепная реакция бывает двух типов: Качественная — проводится с целью обнаружения патогена в крови обследуемого. ПЦР сдают как для диагностики болезни, так и для мониторинга его лечения.
Положительный результат указывает на наличие инфекции в крови больного и об эффективности ПВТ, если таковое было. Отрицательный чаще всего является следствием отсутствия патогена. Количественная — проводится после установки диагноза с целью вычисления уровня вирусной нагрузки.