Анализ ПЦР на HCV, виды: отрицательный, положительный и расшифровка. Полимеразная цепная реакция почти для каждого из нас стала обыденностью, даже если этот каждый никогда и слов таких не слышал. Как расшифровать качественный тест на антитела к коронавирусу. Разобравшись, чем отличается тест ПЦР от антител на КОВИД, удастся облегчить диагностику коронавирусной инфекции, избежать лишних финансовых трат на несвоевременные или недостоверные обследования.
ПЦР-15 - 93.570
Положительным считается результат, превышающий 1 относительную единицу. В отличие от ПЦР-анализа, ответы Digene-теста клиники готовят в течение 10 дней. Если получен результат ниже количественно значимого порога, будет выдан ответ «не обнаружено». Поэтому результаты дайджен-теста и качественного ПЦР-анализа, в котором даже минимальное количество вируса считается положительным результатом, могут быть противоположными. Врачи рекомендуют проходить digene-тест, поскольку при прочих равных он выгоднее в финансовом плане — после получения результатов не придется отдельно проводить количественный анализ. Подготовка к анализам Как уже говорилось, и в ПЦР-анализе, и в дайджин-тесте используется генетический материал.
Для его получения необходимо выполнить забор клеток эпителия из урогенитального тракта. Обычно у женщин берут соскоб из цервикального канала, у мужчин — из уретры. Иногда используется материал из прямой кишки, полости рта — при наличии там новообразований. В отличие от многих других ПЦР-анализов, при исследовании ВПЧ не используют кровь, поскольку вирус в ней практически не обнаруживается. Рекомендации для женщин: Чтобы получить достоверные результаты, женщине рекомендуют сдавать анализ не раньше чем через 5 дней после начала менструального цикла и не позже чем за пять дней до его окончания.
Первым днем цикла считается первый день менструации. Оптимальное время сдачи анализа — первая половина цикла; За сутки до проведения исследования и в тот же день исключаются интимные контакты, спринцевания, использование интравагинальных лекарственных и контрацептивных средств; УЗИ органов малого таза с использованием интравагинального датчика, кольпоскопию и соскоб разносят во времени на 3-4 дня. Рекомендации для мужчин: не мочиться за 2-3 часа до соскоба из уретры; отказаться от интимных контактов за 2 суток; общие рекомендации: закончить прием антибиотиков перорально или в виде инъекций за месяц до обследования; прекратить лечение с помощью местных антибактериальных или антисептических средств за 2 недели до обследования; в день обследования не мыть половые органы с использованием антибактериального мыла или геля. Все это относится к плановой сдаче анализов, но если при обращении к врачу обнаружены патологические изменения, соскоб берут сразу же, без подготовки. Процедура забора материала У женщин клетки эпителия берут на гинекологическом кресле с помощью одноразовой цитологической щеточки, которую вводят в цервикальный канал на 1-1,5 см, несколько раз прокручивают вокруг оси, затем аккуратно вынимают так, чтобы не загрязнить материал вагинальными выделениями.
Это безболезненная и быстрая процедура. Мужчине в уретру вводят специальный зонд, всего на 3-4 см, так что болевых ощущений тоже не будет. Затем зонд или щеточку опускают в пробирку с жидкостью, прополаскивают, отжимают о стенки, вынимают. Пробирку закупоривают и отправляют в лабораторию. Стоимость забора материала в клиниках в среднем составляет 400 руб.
Эту сумму прибавляют к сумме за само исследование. Сроки проведения анализов Первично анализ на ВПЧ рекомендуется сдать в следующих ситуациях: при плановом гинекологическом осмотре женщины старше 30 лет если результата будет отрицательным, анализ рекомендуется сдавать каждые три года ; при получении сомнительного цитологического мазка ПАП-теста ; после обнаружения на осмотре остроконечных кондилом, диспластических изменений шейки матки. Если у женщины старше 30 лет анализ на онкогенный штамм ВПЧ положительный, это может означать, что инфекция персистирует, и иммунитет не может уничтожить возбудителя. До этого возраста опасность невелика — обычно повторные анализы оказываются «чистыми». Когда наряду с положительным анализом присутствуют изменения в цитологическом мазке, это значит, что риск развития онкологической патологии высок.
В этом случае рекомендуется пройти расширенную кольпоскопию с биопсией шейки матки. Одновременно назначается противовирусная терапия. Повторные анализы рекомендуется сдавать в той же лаборатории, где и первичный. Так удобнее сравнивать результаты. Перед беременностью анализ на ВПЧ необязателен.
Заражение папилломавирусом не считается опасным, никак не влияет на протекание беременности и здоровье ребенка. Однако падение иммунитета в этот период нередко приводит к появлению остроконечных кондилом, если женщина инфицирована типами 6 и 11. Контакт дыхательных путей ребенка во время родов с кондиломами может привести к формированию ювенильного папилломатоза гортани. Это редкое заболевание, поскольку формируется только на фоне сниженного иммунитета у самого ребенка, но все же ради своего спокойствия стоит сдать анализ заранее.
Кроме того, с помощью ПЦР можно определить латентных носителей инфекции. Необходимо строго соблюдать правила сбора биоматериала и его хранения. Важно выбрать правильное время взятия биоматериала и выполнить правила подготовки к тесту.
В частности, это касается и нового коронавируса, который присутствует в выделениях носоглотки и ротоглотки только в течение определенного времени, по истечении которого анализ окажется отрицательным. Кроме того, высокая чувствительность ПЦР может иногда превращаться из преимущества в недостаток. Показания к проведению ПЦР-анализа ПЦР-тесты используются для: диагностики инфекционных заболеваний, вызванных вирусами, бактериями и грибами, в том числе для определения возбудителей ряда урогенитальных инфекций; определения патологических генетических нарушений; определения роста и развития раковых клеток. ПЦР тест также можно использовать для прямой диагностики наличия заболевания и мутаций в развивающемся эмбрионе. Например, впервые ПЦР была использована таким образом для диагностики серповидно-клеточной анемии путем обнаружения мутации одного гена. Как проводится ПЦР-анализ Метод полимеразно-цепной реакции постоянно развивается. Самым распространенным на сегодня является тест в реальном времени, с помощью которого можно определить исходное количество копий ДНК РНК.
ПЦР с вложенной парой праймеров гнездовая проводится в две стадии для снижения вероятности амплификации неспецифичных участков ДНК. Инвертированная ПЦР используется в случае, когда нужно выяснить природу неизвестных участков ДНК, окружающих известный.
У пациента берется биологический материал. Затем он обрабатывается особым образом с помощью специальных химических реагентов. Затем получившуюся смесь помещают в особую машину, которая проводит процесс амплификации. То есть многократного умножения определенных фрагментов ДНК или РНК, что удалось выявить с помощью добавления реагентов.
Когда процесс амплификации подойдет к концу, доктору остается только идентифицировать полученные результаты, чтобы поставить верный диагноз. Главное — проявить внимательность на этапе идентификации. Но учитывая, что сегодня большую часть работы делает компьютер, все сильно упрощается. ПЦР отличается высокой эффективностью. Ее широко применяют для того, чтобы определять наличие в организме скрытых инфекционных процессов, которые не дают положительных серологических реакций. Также скрытые инфекции обычно нельзя выявить с помощью посева или микроскопии.
Поэтому зачастую ПЦР — единственный достоверный способ постановки диагноза в этом случае. Какие материалы можно использовать для ПЦР Часто удачность исследования зависит от того, как и какой материал брался для выполнения анализа. Однако в случае с полимеразной цепной реакцией расшифровка результатов ПЦР исследований мало зависит от биологического материала, который брался у пациента. Гораздо большее значение имеет подготовка к обследованию с помощью метода. В качестве материала могут служить: кровь, сдаваемая в соответствии со стандартными рекомендациями из вены на локтевом сгибе мокрота, собираемая при откашливании налет с ротовой полости, собираемый доктором в утреннее время, пока пациент еще не завтракал и не чистил зубы мазок с половых органов, дающий хорошие результаты в том случае, если больной не мочился в течение нескольких часов, отказывался от сексуальных контактов несколько дней и соблюдал ряд других рекомендаций исследование мочи, при котором биоматериал также предпочтительно собирать с утра, не проводя накануне гигиену половых органов биоптаты органов или тканей, получаемые с помощью специальных инструментов и др. Как отмечают врачи, материалом для ПЦР может быть совершенно любая жидкая среда организма человека.
При выборе главное помнить о том, что предпочтение отдают той среде, где с большей долей вероятности будет присутствовать возбудитель. Например, при половых инфекциях целесообразнее брать мазок с половых органов или кровь, чем мазок из ротовой полости. Решать вопрос о том, какие материалы используются для получения результатов ПЦР в том или ином случае, лучше всего с лечащим врачом на приеме. Доктор сделает оптимальный выбор, исходя из предполагаемого у пациента заболевания. Предположим, доктор поставил себе цель обнаружить какой-то патогенный микроорганизм в теле пациента. И если тот на самом деле присутствует в теле, он будет обнаружен.
При этом спутать его с каким-либо другим патогеном благодаря уникальному коду ДНК будет невозможно. Ведь методика рассчитана, в отличие от многих других диагностических методов, именно на поиск самих возбудителей, а не их следов. Как отмечают доктора, при данном исследовании вероятность случайно принять один возбудитель за другой сводится к нулю. Зато существует вероятность получения положительных результатов после терапии.
К тому же там не упоминалась возможность экспоненциальной репликации — отличительной черты ПЦР. В суде представители DuPont так и не смогли доказать вторичность изобретения Мюллиса. С этой сделки Cetus выплатила Кэри Мюллису неоправданно малую сумму, фактически ограбив его. Принцип метода Все мы знаем, что ДНК — это двухцепочечная молекула, где каждая цепочка состоит из звеньев-нуклеотидов. Нуклеотиды составлены из трех молекул: остатка фосфорной кислоты, сахара и азотистого основания. Если сахар и фосфат одинаковы у всех нуклеотидов в ДНК в РНК сахар другой , то азотистых оснований четыре если не считать редкие модификации : аденин, тимин, цитозин и гуанин, обозначаемые А, Т, Ц и Г соответственно.
В молекулах РНК тимин заменен урацилом. Нуклеотиды соединяются в цепочку, образуя связи между фосфатной группой одного нуклеотида и гидроксильной — другого. Чтобы молекула была стабильной, цепочки должны как-то взаимодействовать друг с другом. Это обеспечивают водородные связи , образующиеся между азотистыми основаниями противоположных цепей по принципу комплементарности : А соединяется только с Т или У в РНК , а Г — с Ц рис. И поэтому, имея одну цепь ДНК, в соответствии с этим правилом легко построить ее пару. Собственно, на этом и основана ПЦР. Рисунок 5. Строение ДНК. Видео 2. Типичная реакционная смесь Анализируемая ДНК.
Это может быть как отдельный кусочек молекулы, так и плазмида, хромосома или геном клетки полностью. Для грубой оценки сойдет даже суспензия клеток. ДНК служит матрицей для многократного копирования нужного участка. Праймер — это искусственно синтезированная короткая цепочка нуклеотидов 15—30 штук , комплементарная выбранному участку одной из цепей анализируемой ДНК. Один из праймеров обычно соответствует началу амплифицируемого отрезка, другой — его концу, но на противоположной цепи. Фермент, строящий комплементарную матричной цепь ДНК. Обычно используют термостабильные полимеразы, изначально выделенные из термофильных бактерий и архей: Thermus aquaticus Taq-полимераза , Pyrococcus furiosus Pfu-полимераза и Pyrococcus woesei Pwo-полимераза. Первая — самая производительная, а две другие — более точные. Раствор, содержащий различные ионы для поддержания нужного рН, соли магния, необходимые для работы полимеразы, и неионный детергент Tween-20 в сочетании с BSA бычьим сывороточным альбумином для предотвращения налипания компонентов реакции на стенки пробирки. В случае ГЦ-богатых матриц в смесь часто добавляют энхансер — ДМСО диметилсульфоксид , предотвращающий нежелательные взаимодействия между комплементарными участками матрицы.
Рисунок 6. Состав смеси для ПЦР. Соблюдение правильного соотношения — большая проблема для лабораторий, где в сутки проводят несколько тысяч ПЦР: достаточно незначительно изменить концентрацию солей магния, и результаты ПЦР будут далеки от идеала. ПЦР в режиме реального времени рекомендуется для мультиплексной ПЦР и генотипирования с применением олигонуклеотидных зондов. Материал предоставлен партнёром — компанией «Диаэм» Все компоненты смешивают в нужном объеме деионизованной воды в специальных пробирках для ПЦР и помещают в амплификатор или ПЦР-циклер рис. Рисунок 7. Расходные материалы и оборудование для ПЦР. Видео 3.
Какой метод диагностики лучше?
- ПЦР анализ 12: что это такое? Подготовка и сдача анализа, расшифровка результатов
- О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19
- ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
- Список литературы
Расшифровать анализ ПЦР онлайн
ПЦР-тест на ковид – надежный метод, позволяющий определить наличие ДНК вируса в организме с первого дня инфицирования. Если вируса нет, а в ПАП-тесте указано «NILM», тестирования раз в 3 года будет совершенно достаточно. ПЦР-тест даст более точный результат, если врач возьмет у пациента мазок с первого по пятый день заболевания. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — это лабораторно–диагностическое исследование, позволяющее определить возбудителя той или иной инфекции. Отличие иммуноферментного анализа (ИФА) от полимеразной цепной реакции (ПЦР) в том, что ПЦР относится к прямым методам выявления возбудителя инфекции, то есть позволяет определить РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале человека.
ПЦР диагностика: что это такое
Сдать кровь лучше в первой половине дня. До процедуры не курить. Также следует предупредить доктора о принимаемых лекарственных препаратах, возможных проблемах со здоровьем, хронических заболеваниях. Забор крови выполняется из вены.
После окончания процедуры место прокола медсестра заклеивает стерильным пластырем, предупреждает о необходимости согнуть руку и держать ее в таком положении 10—15 минут. В противном случае высока вероятность появления болезненной гематомы. Сколько по времени делается исследование?
Сколько делается анализ, зависит от лаборатории. Средний срок выполнения колеблется в пределах 1—3 дней. Некоторые клиники предоставляют платную услугу быстрой постановки ПЦР, однако время проведения ограничивается возможностями медицинской аппаратуры.
В поликлинике результаты могут передаваться врачу в течение 7—10 дней. Это связывают с большим наплывом пациентов. При этом биологический материал хранится в соответствии со всеми требованиями.
Расшифровка результатов Как правило, расшифровка качественной ПЦР не представляет сложности. Но во избежание ошибочной трактовки, с полученным из лаборатории бланком следует обратиться к врачу. Варианты, что означает та или иная разновидность ПЦР, приведены в таблице.
Вид исследования Возможный результат и предполагаемая расшифровка Качественная ПЦР Отрицательный: человек здоров либо концентрация вирусной РНК в крови слишком мала для детекции. Положительный: человек инфицирован Проводится, если обнаружено РНК вируса качественным методом исследования. В зависимости от того, какие результаты анализов получены, определяется уровень вирусной нагрузки Генотипирование Проводится при гепатите С, подтвержденном другими методами исследования.
Анализ позволяет установить точный генотип возбудителя патологии Но нередко возникает ситуация, когда ИФА на гепатит С положительный, а ПЦР отрицательный. Расшифровать такие результаты анализов может только врач. Однако подобные данные возможны в следующих случаях: беременность; перенесенный в острой форме гепатит С; пройденный курс лечения от HCV; наличие инфекций, повышающих вероятность ложноположительного результата ИФА.
Только полимеразная цепная реакция показывает точное наличие вирусной инфекции в организме. Но врачу следует точно установить причину ложноположительного результата. Качественный анализ Анализ ПЦР качественный на гепатит С подтверждает присутствие возбудителя заболевания в крови.
Если РНК вируса не обнаружена, человек здоров. Но при подозрении на инфицирование рекомендуют повторно пройти исследование. Положительный результат свидетельствует об инфицировании.
Но этот анализ не позволяет дифференцировать хронический гепатит С от острого, и не может показать, насколько активен патологический процесс. Количественный тест Количественный анализ методом ПЦР проводится после подтверждения диагноза и его расшифровка важна для определения тактики лечения. В зависимости от концентрации частиц возбудителя гепатита С выделяют несколько степеней вирусной нагрузки: средняя, высокая и низкая.
Чем больше показатель, тем тяжелее протекает инфекция и сложнее терапия.
Так какой же анализ сдать именно Вам? Разбираемся вместе. Если Вы проводите анализ на COVID-19 для какой-либо организации, то следует уточнить - Какой конкретно необходим, для самой организации. Если же Вы решили узнать для себя, то и выбирать только Вам, например: - Если Вы сдадите мазок — То узнаете, болеете ли на данный момент или нет. Будете знать, что идёт острая фаза — с 7 по 21 день.
Будьте здоровы, берегите себя и своих близких!
Результат может быть готов уже в день сдачи анализа. С помощью ПЦР выявляют возбудителей латентных заболеваний, когда возбудитель в организме есть, но он еще не вызвал заболевание, или когда пациент является носителем инфекции гепатита или ВИЧ. Низкая стоимость. Цена анализа ПЦР на одного возбудителя составляет 250-500 рублей. Чуть дороже стоит полуколичественный анализ на вирусы — около 1000 рублей. Недостатки анализа ПЦР является высокотехнологичным методом исследованием и предъявляет высокие требования к оснащению лаборатории. Помещение, где делают анализ, обязательно должно быть оснащено фильтром биологической очистки, так как в воздухе постоянно присутствуют частицы кожи, слюны, содержащие в своем составе молекулы ДНК.
Несоблюдение техники работы с биоматериалами может стать причиной неверного результата.
Клиническая информация о тесте ПЦР-15 — это комплексное качественное исследование ДНК возбудителей инфекций органов репродукции. Метод ПЦР позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК микроорганизмов, не выявляемые другими методами. Анализ выявляет наличие вируса папилломы человека высокоонкогенного риска, вируса герпеса, возбудителей инфекций передаваемых половым путем, возбудителей анаэробных инфекций. Интерпретация результатов Повышенные значения: наличие одной или нескольких исследуемых инфекций. Пониженные значения: отсутствие инфекции. Срок выполнения.
ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
| Что такое ПЦР-анализ? | В расшифровка анализа анализах ПЦР на гепатит С, полученных из лаборатории, обычно указывают определённые данные, и расшифровать их можно даже самостоятельно. |
| Расшифровка анализа пцр | Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году Кэри Мюллис (американский учёный). |
| ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео) - Симптомы и лечение. Журнал Медикал | ПЦР (полимеразная цепная реакция) — это метод тестирования, который способен находить генетический материал вируса непосредственно в крови пациента, слюне или любой другой жидкости, изобретенный в 1983 году американским биохимиком Кэрри Муллисом. |
| Почему "ошибаются" ПЦР-тесты - эксперт | Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – наиболее информативный, точный и современный метод диагностики инфекционных заболеваний, позволяющий обнаружить возбудителя в организме пациента, даже если количество вредоносных клеток исчисляется единицами. |
ПЦР - что это такое?
- ПЦР на гепатит С: качественный и количественный анализ крови, расшифровка результатов
- ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
- История метода
- Количественная ПЦР: суть анализа и расшифровка результатов
- Содержание:
Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК
В расшифровка анализа анализах ПЦР на гепатит С, полученных из лаборатории, обычно указывают определённые данные, и расшифровать их можно даже самостоятельно. ПЦР-тест (Мазок) на Коронавирус. Предназначение у него одно: определить есть ли вирус COVID-19 в организме в данный момент (Real-Time PCR). ПЦР-тест (Мазок) на Коронавирус. Предназначение у него одно: определить есть ли вирус COVID-19 в организме в данный момент (Real-Time PCR). Полимеразная цепная реакция почти для каждого из нас стала обыденностью, даже если этот каждый никогда и слов таких не слышал. Анализы при гепатите С с расшифровкой (ПЦР) являются надежным показателем наличия вируса в крови человека. Чтобы диагностировать присутствие вируса в организме, сначала появились тесты ПЦР – полимеразной цепной реакции.
В Минздраве объяснили, от чего зависит результат ПЦР-теста
это методика, позволяющая выявить даже небольшие концентрации возбудителя инфекции. В больницу пациентов с COVID-19 госпитализируют, как правило, после того, как им сделали ПЦР-тест. Однако в случае с полимеразной цепной реакцией расшифровка результатов ПЦР исследований мало зависит от биологического материала, который брался у пациента. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является мощнейшим инстументом современной молекулярной биологии. Родоначальником метода ПЦР (полимеразной цепной реакции) считается ученый из Норвегии Х. Клеппе. Что это такое, какие заболевания выявляет, в чем преимущества и недостатки анализа и что значат его результаты.
ПЦР анализ: что это такое? На какие 12 инфекций сдается?
| ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео) | по Менеджменту антикоагулянтной терапии, утвержденное Министерством Здравоохранения РМ, рекомендует для оценки рисков венозных тромбоэмболий использовать тесты на Д-Димеры со специфичностью не менее 75. |
| Антитела к гепатиту С: что означает их обнаружение в крови | Трёхбуквенный вариант — это аббревиатура названия «полимеразная цепная реакция». |
Результаты ПЦР диагностики
Несомненное преимущество метода — оперативность. Постановка реакции занимает несколько часов, таким образом, вся диагностика, от момента сдачи материала на анализ до получения результата, отнимет всего один день. При помощи ПЦР определяют возбудителя , а не реакцию на его внедрение со стороны организма. Таким образом, появилась возможность точно диагностировать заболевание еще в инкубационном периоде, когда нет никаких клинических или лабораторных признаков болезни.
Но они напрямую связаны с его достоинствами и с так называемым «человеческим фактором». ПЦР — очень высокотехнологичный метод, требующий соблюдения строжайших правил оснащения лаборатории. Это связано с тем, что в воздухе постоянно присутствует невероятный коктейль из фрагментов ДНК всевозможных живых организмов, и в процессе подготовки к проведению реакции образец может быть загрязнен — возможно «ложное срабатывание».
Оценивать результаты реакции должен практический врач, который лечит конкретного больного. Дело в том, что далеко не всегда положительный ответ теста означает наличие заболевания. Например, человек пролечился от какого-либо заболевания, но погибший и уже не опасный возбудитель будет еще некоторое время «разбираться на запчасти» защитной системой организма.
Если в этот момент сделать ПЦР — результат окажется положительным. Другой вариант — это отрицательный результат ПЦР при наличии даже явной клинической картины. Одна из наиболее возможных причин — материал для исследования был взят «не оттуда».
Образец должен брать квалифицированный врач, строго следуя инструкции, которую ему дает лаборатория. Когда следует бежать в лабораторию, чтобы проанализировать итоги вашего летнего отпуска? Специалисты советуют делать это в следующих случаях: выделения, зуд, чувство жжения в области половых органов, резко изменившийся запах от половых органов, дискомфорт при мочеиспускании, необычный характер выделений цвет, количество, консистенция , случайный половой контакт без применения презерватива.
Для анализа используется венозная кровь 1—1,5 мл , собранная у пациента натощак в стерильную пробирку. Замораживать кровь категорически запрещается. Биологические жидкости. К ним относятся слюна, сок простаты, околоплодная, плевральная, спинномозговая, суставная жидкости. Собираются при помощи пункции с использованием стерильного инструментария в количестве 0,1—1,5 мл в стерильные пробирки. Биоптаты, то есть материалы, полученные путем биопсии. Обычно на анализ отправляют биоптаты двенадцатиперстной кишки или желудка, чтобы выявить хеликобактерную инфекцию. Объем материала 2—3 мм3. Хранение и транспортировка биоматериала.
Хранить образцы можно при комнатной температуре не более 2 часов. Оттаивание и повторное замораживание проб запрещено. Транспортировка, если она необходима, должна проводиться в специальных термоконтейнерах или термосах с соблюдением всех правил хранения и перевозки биоматериалов. Выделение ДНК из образца. Способ выделения зависит от вида определяемого микроорганизма и от вида биологического образца. Если, например, анализируется соскоб эпителиальных клеток, используется так называемый метод твердофазной сорбции, заключающийся в добавлении в образец специального вещества, концентрации ДНК на сорбенте и его многократной отмывке буферным раствором. Проведение ПЦР. Некоторое количество образца из биологической пробы переносится в специальную микроцентрифужную пробирку. Туда же добавляется амплификационная смесь, имеющая сложный состав, в объеме 25 мл.
Пробирки устанавливают в программируемый термостат, и автоматическом режиме проводится амплификация. Время ее проведения зависит от заданной программы и составляет 2—3 часа. Одновременно с опытными пробами проводятся контрольные — положительные, включающие в себя контрольный препарат ДНК исследуемого возбудителя, и отрицательные, не содержащие исследуемую ДНК. Количество циклов амплификации варьирует от 30 до 40, более 40 циклов проводить не рекомендуется, так как это способствует увеличению количества неспецифических продуктов в пробе. Регистрация результатов. Фрагмент ДНК, характерный для возбудителя инфекции, выделяют методом электрофореза в присутствии специального вещества — бромистого этидия. Его соединение с фрагментами ДНК дает светящиеся полосы при облучении ультрафиолетовым излучением. Образец помещают в камеру для электрофореза и в течение 35—40 минут проводят разделение продуктов амплификации. После этого образец просматривают в ультрафиолетовом свете — наличие оранжевой светящейся полосы свидетельствует о положительном результате.
Это практически правильное решение. Ведь если итоги оказались отрицательными, значит фрагменты патогенного микроорганизма не были определены тест-системой. Из этого следует логичный вывод, что микроорганизма в теле нет. Однако стоит учитывать, что несмотря на всю свою высокую чувствительность и специфичность, методика имеет определенный порог чувствительности. Если концентрация возбудителя на момент обследования не переходит границу этого порога, результат будет расцениваться, как отрицательные. Хотя на самом деле окажется ложным до поры до времени. Доктора акцентируют особое внимание на том, что отрицательный результат не всегда означает отсутствие патологии. Кто из докторов выполняет расшифровку результатов ПЦР Часто среди пациентов звучит вопрос о том, какой врач будет проводить расшифровку ПЦР исследования.
В первую очередь необходимо запомнить, что доверять результаты стоит тому же медицинскому работнику, что первоначально давал направление на исследование. Связана эта рекомендация с тем, что в этом случае доктор будет представлять себе, что он ожидает увидеть в анализах. Сможет грамотно интерпретировать итоги, соотнося их с клинической картиной. Получить направление наиболее часто можно от уролога, гинеколога или венеролога. Соответственно, после получения итогов относить бланк с результатами стоит кому-то из них. Важно помнить, что ПЦР — довольно дорогой метод диагностики. Его не принято использовать просто так, без специальных показаний к обследованию. Среди них: появление специфических для ЗППП симптомов обследование перед планированием беременности или процедурой искусственного оплодотворения поиск причин бесплодия и другие показания Когда показатели ПЦР становятся положительными после заражения Часто пациенты задают на приеме у медицинского работника вопрос о том, когда результаты ПЦР крови и мазков становятся положительными после заражения.
Все зависит от того, насколько быстро конкретная инфекция сможет, размножаясь, пройти пороговую для теста концентрацию в материале. Преимуществом ПЦР является то, что порог чувствительности у теста довольно низкий. Это значит, что выявить признаки заражения можно даже в том случае, если количество возбудителя в биологическом материале будет минимальным. Подобная особенность дает возможность постановки диагноза даже в период инкубации, когда симптомы еще полностью отсутствуют. Однако осечка возможна и при применении ПЦР методики. Это происходит, например, если пороговая концентрация все же не успела достичь определяемых тестом значений. В этом случае велика вероятность получения далеких от правды результатов. Как отмечают доктора, ничего сложного во внешнем виде бумаги нет.
Зачастую на документе можно обнаружить название искомого возбудителя. А напротив него пометку «обнаружен» или «не обнаружен».
Благодаря качественному методу подтверждается присутствие вируса гепатита С и его активное размножение. Количественное определение вирусной нагрузки с учетом генотипа HCV позволяет контролировать проводимую терапию и прогнозировать течение болезни. Эффективность лечения оценивается по количеству РНК до и во время терапии. Обычно вирусная нагрузка крови снижается в несколько раз за первые три месяца успешного лечения.
При эффективной терапии виремия уменьшается на два порядка в первые 4-12 недель лечения и после окончания курса терапии генетический материал вируса в крови не обнаруживается. Отсутствие снижения виремии через 12 недель с начала лечения указывает на его неэффективность. Рекомендовано проводить анализ до начала терапии, на 4-й, 12-й и 24-й неделях лечения и через 24 недели после окончания курса. Длительность терапии и периодичность количественного определения РНК вируса гепатита С зависит от генотипа вируса и степени повреждения печени. Для чего используется исследование? Для подтверждения диагноза «вирусный гепатит С».
Для прогнозирования течения вирусного гепатита С. Для мониторинга противовирусной терапии и решения вопроса о дальнейшей тактике лечения.
Анализ ПЦР на гепатит С
Вот теперь можем переходить непосредственно к ПЦР. Ученые уже десятилетия изучают свойства ДНК. Выделяют из живых организмов, синтезируют искусственно... Потому что когда его мало, то труднее ставить эксперименты - проще запороть, загрязнить чем-то чужеродным и т. И тогда в далеком 1983м один любящий галлюциногены ученый Кэри Муллис решил использовать для этого то, что давно уже придумала природа - репликацию, только искусственную, в пробирке.
Нобелевку по химии за это получил, кстати... За основу взяли все основное, что есть в "натуральной" репликации - собственно ДНК, полимеразу, свободные буквы-нуклеотиды, чтобы ей было что вставлять в новую цепь, и праймеры - затравку, которая покажет полимеразе, откуда ей начать свое грязное дело. Путем долгих манипуляций и экспериментов выяснилось, что оптимальнее всего смешать все это и поставить на определенный температурный режим, где каждый этап реакции будет происходить на своей заданной температуре. Этапа всего три: 1 Денатурация.
При 95 градусах двойная спираль ДНК распадается на две нити разрушаются те самые слабые водородные связи между комплементарными нуклеотидами. При 40-60 градусах в зависимости от ряда факторов маленькие затравки находят комплементарный участок на одиночной цепи и садятся на него. При 72 градусах полимераза садится на затравку и начинает достраивать новую цепь, пользуясь старой как шаблоном. Откуда именно 72 градуса - очень интересная история о пользе фундаментальной науки, как-нибудь в другой раз.
В результате такого цикла из одной двойной спирали получаются две! Как несложно догадаться, теперь надо все это повторить еще раз, чтобы из 2 сделать 4, потом 8... Ну, вы поняли - это цепная реакция! Тем не менее, этого хватает, чтобы получить рабочие концентрации ДНК, с которыми можно уже делать серьезное дело.
Аппаратная база. Бедняга Муллис и его последователи сначала использовали тупо три водяных бани с разной температурой, вручную перемещая из одной в другую ценные пробирки с реакцией. Мы на практике в универе почему-то делали так же...
При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно. ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы. Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется. Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов.
Диагностика латентных инфекций. ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков. У нее есть свои ограничения, но их количество настолько незначительно, что не может отрицательно повлиять на популярность и эффективность метода: Вероятность амплификации ДНК не только живого, но и погибшего микроорганизма. При проведении ПЦР-диагностики для контроля эффективности лечения необходимо соблюдать определенные требования. В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка времени 1—2 месяца , за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции в организме. Возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК праймеров осуществляется на основе знаний о генетическом строении конкретного микроорганизма.
Но теоретически такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован. Их присутствие в пробе может привести к ложноположительному результату анализа. Изменчивость микроорганизмов. Эта способность возбудителей к мутации иногда приводит к тому, что некоторые их штаммы становятся неуловимыми в процессе ПЦР-анализа. Чтобы уменьшить риски, разработаны стандарты объемов испытаний тест-систем ПЦР-диагностики, включающие проверку на перекрестные реакции и тестирование всех известных штаммов конкретного возбудителя. Забор биоматериала. Процедура, предшествующая непосредственному анализу, которая осуществляется в процедурном кабинете соответствующего профиля. Забор делается с помощью стерильного оборудования только в стерильные пробирки. Материалом для исследования могут быть: Эпителиальные соскобы со слизистых оболочек: из уретры, из цервикального канала, со слизистой дыхательных путей и зева, из конъюнктивы.
Забор проводится с помощью специального ершика, при этом недопустимо попадание в материал следов крови. Собираются первые 50 г утренней мочи в стерильную емкость. Материал используется для диагностики мочеполовых инфекций.
Поскольку этого анализа недостаточно для постановки окончательного диагноза, обратившийся проходит дополнительное обследование. При помощи анализа крови биохимии определяют концентрацию трансаминаз и билирубина. Спустя месяц после первого теста анализ на антитела к гепатиту С пересдается. Если РНК вируса выявлена, определяют ее уровень в крови.
Если все результаты окажутся положительными, пациенту ставится диагноз — гепатит С, назначается лечение у врача-инфекциониста. Что это такое? ПЦР — это цепная полимеразная реакция на гепатит. Для анализа требуется специальный аппарат, который определяет количество антител в сыворотке крови в кровяном сгустке. Анализ на ПЦР назначают беременным так как вирус гепатита способен проникать через плацентарный барьер и заражать ребенка и людям, которые контактировали с инфицированными больными. Анализ делается двумя методиками. Качественный показывает, присутствуют ли антитела в русле крови.
То есть качественный анализ выясняет, нужно ли лечение для конкретного больного. Количественный анализ проводится в случае обнаружения маркеров в крови. Специальный аппарат подсчитывает точное количество клеток вируса гепатита. Этот анализ позволяет отслеживать динамику терапии, насколько оно эффективно и не требует ли коррекции. Единственный минус этого анализа: аппарат не способен посчитать количество вируса гепатита, если в крови его практически нет. В крови циркулируют антитела или незначительное количество возбудителя. Такое возможно, если пациент проходит лечение и курс подходит к концу.
Если анализ переделать через 4-6 недель после окончания лечения — результат может оказаться совершенно иным. Поверхностный австралийский антиген и маркеры к нему HBsAg — чужеродный белок, образующий внешнюю оболочку вируса гепатита Б. Антиген помогает вирусу цепляться за печеночные клетки гепатоциты , проникать в их внутреннее пространство. Благодаря ему вирус успешно развивается и размножается. Оболочка поддерживает жизнеспособность вредоносного микроорганизма, дает ему возможность продолжительное время находиться в человеческом организме. Белковая оболочка наделена невероятной устойчивостью к различным негативным воздействиям. Австралийский антиген выдерживает кипячение, не погибает при замораживании.
Белок не утрачивает свойств, попав в щелочную или кислую среду. Он не разрушается от воздействия агрессивных антисептиков фенола и формалина. Выделение антигена HBsAg происходит в период обострения. Максимальной концентрации он достигает к концу инкубационного периода примерно за 14 дней до его завершения. В крови HBsAg сохраняется на протяжении 1-6 месяцев. Затем численность патогена начинает сокращаться, и через 3 месяца его количество приравнивается к нулю. Когда при профилактическом обследовании у здорового пациента обнаруживают антиген HBsAg, сразу не делают вывод о том, что он инфицирован.
Сначала подтверждают анализ, проведя другие исследования на присутствие опасной инфекции. Людей, у которых антиген обнаружен в крови спустя 3 месяца, относят к группе вирусоносителей. Часть из них будет заразна до конца жизни. Медики предполагают, что австралийский антиген, пребывая в организме продолжительное время, провоцирует возникновение раковых опухолей. Если при исследовании крови получают положительный результат, это означает, что человек инфицирован. Суммарные антитела к поверхностному антигену вируса находят у пациента при начавшемся выздоровлении. Происходит это после удаления HBsAg, обычно по прошествии 3-4 месяцев.
Anti-HBs защищают человека от гепатита B. Они прикрепляются к вирусу, не позволяя ему разноситься по организму. Благодаря им иммунные клетки быстро вычисляют и убивают патогенных микроорганизмов, не дают прогрессировать инфекции. Суммарная концентрация, появляющаяся после инфицирования, используется для выявления иммунитета после прививки. Нормальные показатели говорят о том, что целесообразно проводить повторную вакцинацию человека. Со временем суммарная концентрация маркеров этого вида понижается. Впрочем, встречаются здоровые люди, у которых антитела к вирусу существуют пожизненно.
Возникновение Anti-HBs у больного когда количество антигена устремляется к нулю считают положительной динамикой заболевания. Пациент начинает выздоравливать, у него появляется постинфекционный иммунитет к гепатиту. Ситуация, когда при остром течении инфекции обнаружены маркеры и антигены, свидетельствует о неблагоприятном развитии болезни.
Не требуется искусственно выращивать возбудитель. На постановку реакции нужно всего лишь несколько часов, то есть результат можно получить в течение дня. Диагностику заболевания в инкубационном периоде. Анализ определяет возбудителя, а не реакцию организма на него. Выходит, что можно поставить точный диагноз, когда болезнь еще никак себя не проявила. Для анализа подходит большинство разновидностей биоматериала — слизь, моча, кровь, сыворотка, мокрота, эякулят, соскоб эпителиальных клеток, гной, жидкости из абсцессов. Особенности применения ПЦР-теста Метод используют везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Возбудители многих инфекций имеют несколько штаммов, поэтому точная диагностика гарантирует и эффективность лечения. Анализ проверен временем, тщательно апробирован клинически, поэтому его часто назначают в качестве дополнительного обследования, чтобы выявить определенный тип вируса или микроба. Кроме медицины метод нашел применение в генетике, криминалистике, археологии. ПЦР-диагностика играет ведущую роль в выявлении неврологических и урологических заболеваний. Использование передовых технологий позволяет: определить причины острых уретритов — берут соскоб клеток из мочеиспускательного каналы у мужчины или женщины, влагалища, цервикального канала; диагностировать циститы, особенно хронические — через мочу или соскоб из шейки мочевого пузыря; тщательно обследовать простатит — берется секрет простаты; определить воспалительные заболевания головки полового члена и крайней плоти — соскоб клеток высыпаний; диагностировать ряд кожных патологий.
ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
Точное расшифровка названия ПЦР — это полимеразная цепная реакция, которая способна выявлять даже единичные бактерии и вирусы, то есть в очень малых концентрациях. Чаще всего ПЦР-тест показывает ложноположительный результат из-за наличия в носу или ротоглотке фрагментов уже погибшего вируса, рассказал в интервью Лайфу доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Антон Ершов. Расшифровка результатов ПЦР-анализа на папилломавирус, Digene-теста и их разновидностей не отличаются, поскольку количество микроорганизмов и их тип не зависит от метода обнаружения.
Общая информация об исследовании
- ПЦР-диагностика: что это такое?
- Анализ ПЦР на гепатит С
- Что такое анализ ПЦР? - статья лаборатории ДНКОМ
- Анализ ПЦР на гепатит С: качественный, количественный, показания и подготовка | MedAboutMe
HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР]
Берется кровь из пальца либо из вены. Это очень удобно, если необходимо протестировать много людей вне медицинского учреждения. Например, летом 2020 года власти Германии решили бесплатно тестировать таким методом иностранных туристов, которые прибывали в аэропорт. Особенно важно провериться на наличие антител IgG и IgM тем категориям населения, которые контактируют со множеством людей и находятся в группе риска. ПЦР тест Этот вид диагностики коронавируса признан лучшим из-за надежности. Такой тест не только помогает обнаружить носителя инфекции, но и вовремя выявить контактирующих. В 1993 году автор методики полимеразной цепной реакции, Кэри Мюлис, получил Нобелевскую премию по химии. Ее суть в том, что берется фрагмент ДНК в малой концентрации и значительно искусственно увеличивается при помощи ферментов.
PCR считается самым чувствительным, потому что определяет наличие возбудителя и его количество, даже когда содержание минимальное. Анализ этим методом особенно актуальный при бессимптомном течении заболевания. Сдавая ПЦР тест, можно получить еще несколько преимуществ: проверить на генетическом уровне собственное здоровье; выявить вирус на ранней стадии; обнаружить другие вредоносные микроорганизмы. В основе PCR диагностики — технология инвитро in vitro. Эта методика позволяет проводить эксперимент вне живого организма — в пробирке.
Что показывает анализ ПЦР Анализ позволяет обнаружить присутствие генетического материала инфекционных возбудителей. ПЦР в гинекологии и в урологии широко применяется для выявления скрытых и труднодиагностируемых инфекций. Принцип работы За генетическую информацию в живом организме любого размера отвечает ДНК — двухспиральная дезоксирибонуклеиновая кислота, состоящая из последовательности четырех нуклеотидов, которые принято обозначать буквами А аденин , Г гуанин , Т тимидин и Ц цитозин. Одно из основных правил генетики — правило комплементарности, то есть нуклеотиды соседних спиралей ДНК соединяются только в определеном порядке: А с Т, Г с Ц, и никак иначе. Рисунок 1. Схема трех стадий полимеразной цепной реакции. Некоторые виды микроорганизмов, например, вирус иммунодефицита человека, хранят генетическую информацию в другой нуклеиновой кислоте — РНК, но и её фрагменты можно находить с помощью ПЦР. Именно на обнаружении этого небольшого, но уникального для каждого отдельного организма участка и построен принцип ПЦР. Для каждого возбудителя создан свой специфический генетический детектор, эталонный фрагмент ДНК, который по принципу комплементарности точно обнаруживает «свой» фрагмент ДНК и запускает реакцию создания огромного количества его копий. Один цикл ПЦР длится около трёх минут, количество копий растёт в геометрической прогрессии. Таким образом, за несколько часов количество фрагментов увеличивается в несколько миллиардов раз. Понятно, что теперь определить, какой возбудитель у данной конкретной инфекции, достаточно легко. Достоинства Теория — это, безусловно, замечательно, но что мы имеем на выходе? Какую практическую выгоду получает человек, когда отправляется на поиски вредоносных микроорганизмов, вооруженный ПЦР? Безусловно, одно из главных достоинств — это универсальность метода. Оборудование, используемое для ПЦР, стандартно, оно не зависит от того, что именно и где именно мы ищем.
Кровь на РНК можно исследовать качественным методом и количественным. В соответствии с названием, качественный метод отвечает только лишь на вопрос, присутствует ли вирус в организме; при исследовании же количественным методом мы получаем информацию, сколько именно единиц вируса содержится в 1 мл крови, то есть можем судить о том, насколько активно размножается вирус. Вирус гепатита С имеет 6 генотипов и большое число подтипов. В нашей стране наиболее распространены первые генотипы 1, 2 и 3. Основная информация, которую дает врачу результат данного анализа, - к каким препаратам вирус чувствителен, то есть определяет выбор правильной схемы лечения. Конечно, в наше время существуют уже и так называемые «пангенотипические» схемы, которые эффективны против всех генотипов вируса. Однако в случае, если генотип вируса известен, количество схем, из которых можно выбирать наиболее подходящую каждому конкретному пациенту с учетом сопутствующих заболеваний и других лекарственных препаратов, которые тот принимает , существенно расширяется. Также данный результат дает дополнительную информацию при дальнейшем наблюдении за пациентом. В случае, если после проведенного курса терапии вновь выявляется вирус, можно с большей вероятностью выяснить, является ли это неудачей лечения или повторным заражением.
Поиск по сайту Что делать, если у меня похожий, но другой вопрос? Если вы не нашли нужной информации среди ответов на этот вопрос, или же ваша проблема немного отличается от представленной, попробуйте задать дополнительный вопрос врачу на этой же странице, если он будет по теме основного вопроса. Вы также можете задать новый вопрос, и через некоторое время наши врачи на него ответят.