В расшифровка анализа анализах ПЦР на гепатит С, полученных из лаборатории, обычно указывают определённые данные, и расшифровать их можно даже самостоятельно. Отличие иммуноферментного анализа (ИФА) от полимеразной цепной реакции (ПЦР) в том, что ПЦР относится к прямым методам выявления возбудителя инфекции, то есть позволяет определить РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале человека. Виды теста методом полимеразной цепной реакции: качественная, количественная и генотипирование. Как правильно сдавать анализ и расшифровка отрицательного результата ПЦР при положительных показателях ИФА. Роспотребнадзор напоминает о ключевых особенностях тестирования методом ПЦР и отвечает на самые часто задаваемые вопросы. ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций.
Количественный анализ: когда он нужен?
- О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19
- Результат может быть:
- Цепная реакция. Как работают тесты на коронавирус?
- Тест на антитела к COVID-19
- Что такое анализ крови на ПЦР, и зачем он нужен
Что значит ПЦР РНК анализ гепатита С?
Расшифровка результатов ПЦР исследований проводится в тот же день, когда получены результаты или в момент обращения к врачу. Что представляет собой анализ методом ПЦР? Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является мощнейшим инстументом современной молекулярной биологии. Дайджин-тест более простой в выполнении, чем ПЦР-анализ, и вместе с этим отличается высочайшей надежностью.
Что значит ПЦР РНК анализ гепатита С?
Третий — это вирус Варицелла-Зостер, которые вызывает ветряную оспу. Четвертый становится виновником мононуклеоза. Пятый — цитомегалии. Шестой влияет на работу головного мозга. Так можно продолжать и далее. Суть в том, что с помощью ПЦР удается выявить сам герпес и его штамм, определить характер и давность поражения, патологического процесса. В этом суть диагностики.
Гепатит Воспаление печени. Полимеразная цепная реакция назначается не только для определения самого факта расстройства. Суть в другом. ПЦР диагностика инфекций дает возможность дифференцировать септические и токсические, прочие формы гепатита, определить конкретный штамм вируса, который спровоцировал патологический процесс. Кандидоз Молочница. Вызывается грибком с идентичным названием.
Поражает слизистые оболочки. В том числе полость рта, половые органы женщины реже — мужчины. Вызывает массу осложнений и дискомфортных ощущений. ПЦР тест назначается в качестве верифицируемого, подтверждающего догадки метода, исследуется параллельно с данными анамнеза, визуальной оценки, симптоматики. Хламидиоз, уреаплазмоз, микоплазмоз и прочие венерические инфекции. На ранних стадиях патологического процесса есть риск не заметить симптомы.
Но именно этот момент — лучший для терапии. Поскольку дальше начинаются необратимые изменения в органах и системах. Болезнь не удается взять под контроль, обеспечить продолжительную жизнь пациенту также невозможно. ПЦР назначается для раннего выявления патологического процесса. Генетические аномалии Любого типа. Потому методика представляет такую ценность для диагностики наследственных аномалий.
Способ не до конца освоен, потому считается перспективным. Как уже было сказано, с помощью методики можно установить отцовство. Используется отдельная модификация анализа. Подготовка к исследованию Меры зависят от того, какой биоматериал будут брать. Вот некоторые варианты: Моча Изучение урины требуется, когда проводят диагностику мочеполовых инфекций, поражений венерического плана у мужчин и женщин. У первых методика применяется не всегда.
Часто ее заменяют забором соскоба из уретры. Перед проведением обследования, накануне запрещена гигиена репродуктивных органов. Анализ сдают в течение суток с момента подозрительного полового акта. Но это не строгое требование, а скорее рекомендация по раннему выявлению патологического процесса.
Чтобы провести полимеразную цепную реакцию, требуется набор особых реактивов.
Исследуемый материал вносится в пробирки с реактивами. При любом цикле, если в образцах имеется последовательность РНК или ДНК возбудителя, то в растворе все больше накапливаются копии частиц данных нуклеиновых кислот. Определить можно и присутствие возбудителя, и количество его в образцах. Качественный анализ методом ПЦР позволяет получить такой результат: отрицательно, когда искомый возбудитель не обнаружен в образцах; положительно, если в образцах найдены последовательности, которые характерны для определенного возбудителя. Например, нарушения техники проведения анализа и правил хранения реактивов могут в значительной степени уменьшить точность исследования.
Количественная ПЦР определяет понятие вирусной нагрузки. Можно определить при этом, сколько в образцах, взятых у пациента, было комплектов ДНК возбудителя. Тяжесть инфекции прямо пропорциональна повышению их количества. Также можно определить успешность терапии по уменьшению вирусной нагрузки. Пациенту во время визита к врачу скажут, что необходимо сдавать: соскоб, мазов, мочу или кровь.
ПЦР может определить возбудителей вне зависимости от уровня загрязнения материала. Для положительного анализа в теории требуется присутствие всего лишь одного возбудителя в образцах. На практике же стараются создать еще более благоприятные условия. Существуют для этого некоторые рекомендации: если сдают соскоб или мазок из половых органов, нужно воздержаться от интимной связи за три дня до исследования; нельзя перед анализом спринцеваться с антибактериальными препаратами или подмываться; за три часа до взятия из уретры мазка нужно потерпеть и не опорожнять кишечник. При сдаче крови пациентом таких правил можно не придерживаться.
Как расшифровываются результаты количественного анализа ПЦР? Такие вопросы особенно актуальны при обследовании людей с хроническими инфекциями вирус человеческого иммунодефицита, гепатиты В и С. При диагностике основываются на том, что накопление ампликонов ПЦР продуктов пропорционально наличию копий искомого гена в анализируемой пробе. Конечно, учет результатов проведения количественной ПЦР делается посредством гель-электрофореза с исследованием интенсивность специальных сигналов ПЦР. Также обязательным условием верной количественной оценки полученных результатов являются положительные надежные контрольные пробы, содержащие известное количество копий искомого гена к примеру, на одну ПЦР-реакцию тысяча копий гена гепатита С.
Несколько последовательных разведений количественного контроля позволяет создать калибровочные кривые, и по ним оценивается содержание в клинических образцах генокопий. В определении количественной ПЦР ключевым достижением стало создание флуоресцентных ДНК-зондов, добавляющихся в реакционную смесь одновременно с простыми праймерами и позволяют отслеживать во времени процесс ПЦР, то есть real-time-ПЦР. Под методологией TaqMan понимается синтез флуоресцентных ДНК-зондов, которые специфичны к средней части ампликона и имеют две метки на концах. Одной из них является флуоресцентная метка, вторая — молекула-гаситель данной флуоресценции. Особый прибор, представляющий собой гибрид флуориметра и термоблока-амплификатора, производит постоянные замеры в каждой пробирке флуоресценции принцип real-time-ПЦР.
После 20-40 циклов ПЦР в результате для каждого образца будут получены индивидуальные кривые. Количество копий искомого гена, который содержится в исследуемом образце, может быть вычислено по калибровочным кривым с контрольными образцами. Также важной особенностью осуществления ПЦР флуоресцентным методом является то, что пробирки со смесью ПЦР нет необходимости открывать при учете результатов. За счет этого снижается возможность заражения продуктами амплификации помещений, и необходимость в выделении особых рабочих областей для проведения электрофореза отпадает. Что показывает расшифровка количественной ПЦР?
Антитела, в свою очередь, это ответная реакция организма на коронавирус. Результат теста на антитела IgG и IgM позволяет понять, на какой именно фазе заболевания находится пациент, а также помогает определить, была ли перенесена инфекция в прошлом. Если Вы хотите максимально точно определить болеете ли Вы, на какой стадии заболевания находитесь или же понять, было ли заболевание в прошлом, то лучшим вариантом будет сдача не только ПЦР-теста, но и теста на антитела. В совокупности, результаты этих тестов дадут самый четкий и информативный результат. Для того, чтобы понять, что означают те или иные результаты, необходимо рассмотреть каждый случай по отдельности: ПЦР — отрицательный, IgG — положительный, IgM — отрицательный. На данный момент, вирус в Вашем организме не выявлен.
Вы были инфицированы коронавирусом ранее, но уже перенесли заболевание и теперь у Вас есть иммунитет к инфекции.
Мы на практике в универе почему-то делали так же... Но как только мир понял, что ПЦР - это офигенно, сразу появились лабораторные приборы, которые этот процесс автоматизируют. Фактически это просто нагревательный блок, способный очень точно держать температуру в течение заданного времени и быстро его менять. Сейчас их на рынке пруд пруди, на любой вкус и цвет, чуть ли не кофе умеют готовить. Но как нам это все помогает при анализах на вирус? Вот такой милаха прогонит ПЦР за полчасика Медицинское применение. Причем ее может быть изначально очень мало, но цепной характер реакции позволит нам ее приумножить. Но если изначально целевой ДНК в пробе нет, то и реакция не пройдет.
Добавляем полимеразу и праймеры, которые сядут именно и только на определенное место в ДНК какого-то интересующего нас патогена ДНК патогена ведь сильно отличается от нашей. Запускаем реакцию и смотрим, прошла она или нет! Если прошла - значит, пациент был заражен этим патогеном, а на нет и суда нет. Получился очень точный, быстрый и относительно дешевый метод выявления патогенов - прикиньте, раньше пока анализ на какую-нибудь бактерию высеешь на питательную среду, дождешься, чтобы оно подросло, определишь, что выросло - несколько дней пройдет. А тут готовый результат за пару часов! Осталось только подобрать такие праймеры, чтобы они садились "отжигались" действительно только на ДНК патогена, а не на человеческую ДНК. Этот трудоемкий процесс и называется созданием тест-системы - наверняка слышали такое словосочетание в новостях! Этим занимаются, как правило, крупные компании, вкладывающие в этот процесс большие деньги и время. Но тут что хорошо - один раз подобрал такие праймеры - и все, дальше любой лаборант с минимальным опытом сможет провести сам анализ.
Дальнейшее развитие ПЦР пошло по пути ответа на вопрос "прошла реакция или нет? Логичным ответом на него стала ПЦР в реальном времени англ. Ну что ж, надеюсь, мне удалось приподнять завесу непонятного и слегка просветить любопытных!
Анализ ПЦР на гепатит С
Тест проводится методом полимеразной цепной реакции качественно и количественно. Тест проводится методом полимеразной цепной реакции качественно и количественно. эксперт Читайте онлайн публикации на актуальные темы на интернет-портале Например, что же означает, когда ПЦР-тест – отрицательный, а антитела IgG и IgM – положительные? Чаще всего ПЦР-тест показывает ложноположительный результат из-за наличия в носу или ротоглотке фрагментов уже погибшего вируса, рассказал в интервью Лайфу доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Антон Ершов.
7 вопросов про ПЦР-тест
| ПЦР-тесты: для чего нужен, как сдавать анализ, цена, можно ли верить результатам | Минимальная вероятность получить ложноотрицательный результат теста на COVID-19 наступает на восьмой день после заражения, или на третий после появления первых симптомов. |
| Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний | Для диагностики папилломавирусной инфекции необходимо сдать анализ на ДНК папилломавируса методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) или гибридизации. |
| Одним мазком: тест на COVID-19 правдивее на восьмой день после заражения | Статьи | Известия | Если ПЦР, экспресс-тест и IgM-антитела отрицательные, это скорее всего значит, что в последние 2-3 недели коронавируса у вас не было. |
| ПЦР на гепатит C: расшифровка количественного и качественного анализа, норма | Расшифровка результатов ПЦР исследований проводится в тот же день, когда получены результаты или в момент обращения к врачу. |
Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA
| 12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция | Виды теста методом полимеразной цепной реакции: качественная, количественная и генотипирование. Как правильно сдавать анализ и расшифровка отрицательного результата ПЦР при положительных показателях ИФА. |
| Анализы на коронавирус. Какие сдавать и что означают результаты? | Расшифровка результатов количественного анализа ПЦР играет важную роль в обнаружении и проверке эффективности лечения большого числа хронических заболеваний, скажем гепатита C. |
| HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР] | Полимеразная цепная реакция почти для каждого из нас стала обыденностью, даже если этот каждый никогда и слов таких не слышал. |
Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК
ПЦР-тест с высокой точностью сообщает о том, есть болезнь или ее нет. Отрицательный ПЦР ("не обнаружено ") тест мазка на короновирус говорит, чтобы вы не выделяйте вирус в окружающую среду и не заразны для окружающих. Расшифровка результатов ПЦР-анализа на папилломавирус, Digene-теста и их разновидностей не отличаются, поскольку количество микроорганизмов и их тип не зависит от метода обнаружения.
Анализы на ВПЧ. Что это такое и как его берут
Аббревиатура ПЦР обозначает полимеразная цепная реакция. В больницу пациентов с COVID-19 госпитализируют, как правило, после того, как им сделали ПЦР-тест. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии, так и задолго до того.
Анализы на коронавирус. Какие сдавать и что означают результаты?
ПЦР-анализ — главный тест и «золотой стандарт» диагностики коронавирусной инфекции Sars-Cov-2 COVID-19 , ставшей причиной самой масштабной пандемии последних десятилетий. Наследственные заболевания и отцовство также диагностируются при помощи метода ПЦР. ПЦР-тесты применяются везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Подготовка к проведению ПЦР-теста Еще одно немаловажное преимущество ПЦР-анализов — это отсутствие специфической подготовки к проведению тестов. Достаточно следовать стандартным рекомендациям специалиста: Анализ сдается утром натощак. При этом ряд генетических исследований проводится в произвольное время, удобное пациенту. При сдаче анализа по мазку из ротоглотки необходимо выдержать интервал с приемом пищи и воды в 3-4 часа перед тестом.
Перед анализом на венерические инфекции необходимо воздержаться от половой активности в течение суток. Перед анализом нельзя использовать никакие противовирусные препараты. Подробную инструкцию по правилам подготовки к каждому анализу вы всегда можете получить у лечащего врача или у консультантов на нашей горячей линии. Как проводится ПЦР-анализ С 1983 года, когда был изобретен данный метод, прошло много времени, и технологии не стоят на месте. Сегодня существует несколько различных методик для проведения ПЦР-теста: С обратной транскрипцией. Самый распространенный способ идентификации известной последовательности РНК, включающий амплификацию, определение патогена и его идентификации среди образцов, хранящихся в научной картотеке.
Вложенная ПЦР или «гнездовая» — используется для снижения количества неспецифичных продуктов реакции и имеет две стадии с использованием двух видов праймеров. Изотермические методы — не требуют повторяющихся температурных циклов, менее энергозатратны. Инвертированная ПЦР — применяется, если имеется только короткий фрагмент известной последовательности, но необходимо определить соседние последовательности после вставки ДНК в геном. ПЦР в реальном времени — метод, позволяющий определить не только присутствие целевой нуклеотидной последовательности в образце, но и измерять количество ее копий после каждого цикла амплификации, что дает возможность для проведения тестов с количественным результатом Это далеко не все существующие на сегодняшний день разновидности ПЦР-технологий.
По этой причине единственным способом диагностики коронавируса остается ПЦР-тестирование. В частности, тогда считалось, что в большей части случаев на это влияют ошибки при заборе материала и качество самого теста. Тем не менее существует и другое обоснование. По словам заместителя директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора профессора Натальи Пшеничной, на результате анализа сказывается период заболевания, в который заболевший сдает ПЦР-тест. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше.
Если проводить тестирование в эти сроки, то можно получить отрицательный результат», — приводит слова специалиста РИА «Новости». Общую картину по тестированию на COVID-19 также дополняет тот факт, что среди новых заболевших появляются и вакцинированные люди, но они при этом выделяют вирус в меньшем количестве и не такое продолжительное время, констатировала замдиректора Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г.
Поиск по сайту Что делать, если у меня похожий, но другой вопрос? Если вы не нашли нужной информации среди ответов на этот вопрос, или же ваша проблема немного отличается от представленной, попробуйте задать дополнительный вопрос врачу на этой же странице, если он будет по теме основного вопроса. Вы также можете задать новый вопрос, и через некоторое время наши врачи на него ответят.
Если у вас все симптомы коронавируса, а результаты теста оказались отрицательными, то это ничего не означает. Значит, плохо выделили РНК. Нужно сдавать еще раз", - говорит он. И добавляет: "Я бы посоветовал людям, которые чувствуют у себя легкую форму коронавируса, не сдавать тест. Ведь человек без хронических заболеваний перенесет все легко. Даже если вы с помощью ПЦР узнаете, что это коронавирус, что это изменит? В больницу все равно вас не примут, а если и примут, то положат в лучшем случае в коридоре. И за вами будут ухаживать загнанные медсестры, которые на вас даже внимание обращать не будут". Поэтому, говорит он, сдавать тест стоит только при симптомах. Не бойтесь ехать в лабораторию сдавать тест. Для вас уже никто не представляет опасности, так как вы уже заболели коронавирусом", - добавляет специалист. Что такое экспресс-тест? Осталось лишь разграничить понятия "ПЦР" и "экспресс-тест". Если первый показывает, есть в организме вирус или нет прямо сейчас, то второй указывает на наличие антител. Если они есть, значит, организм уже справился с болезнью. Хороших экспресс-тестов очень мало. И естественно, бизнес покупает самый дешевый вариант.
Чем отличается ПЦР от антител на КОВИД тест?
Что это такое, какие заболевания выявляет, в чем преимущества и недостатки анализа и что значат его результаты. ПЦР, или полимеразная цепная реакция, представляет собой метод обнаружения инфекций. Анализ крови на ПЦР – лабораторный анализ, помогающий выявить наличие бактериальных и вирусных возбудителей. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) обладает высокой специфичностью при выявлении РНК SARS-CoV-2. Специфичность большинства тестов ОТ-ПЦР составляет 100%, поскольку конструкция праймера специфична для геномной последовательности SARS-CoV-2. В зависимости от причины проведения ПЦР-теста положительный результат может указывать на наличие исследуемого возбудителя.
Для чего используется
- Что вам необходимо сделать
- ПЦР - что это такое?
- Как делают ПЦР анализ?
- ПЦР анализ: что это такое?
ПЦР анализ: что это такое? На какие 12 инфекций сдается?
Повторный анализ спустя месяц прояснит ситуацию. Проблема в том, что ПЦР, хоть и является высокочувствительной реакцией, может не определять минимальные концентрации вирусной РНК. Читайте также: Анализ крови на HCV: что это означает? Анализ крови на HCV представляет собой диагностирование вируса гепатита С.
Вирус гепатита С является РНК-содержащим вирусом. Он поражает клетки печени и приводит к развитию гепатита. Данный вирус может размножаться во многих клетках крови моноцитах, нейтрофилах, В-лимфоцитах, макрофагах.
Для него характерна высокая мутационная активность, благодаря которой он имеет способность избегать действия защитных механизмов иммунной системы организма. Чаще всего вирус гепатита С передается через кровь через нестерильные иглы, шприцы, инструменты для пирсинга, татуирования, при пересадке донорских органов, переливании крови. Также существует риск передачи инфекции во время полового контакта, от матери к ребенку при родах.
Так что это — анализ крови на HCV, в чем заключается его метод исследования? Данный метод диагностики основан на принципе обнаружения в плазме крови пациента антител класса IgG и IgM. В случае попадания в организм человека чужеродных микроорганизмов в данном случае вируса гепатита С иммунная система начинает вырабатывать защитные антитела — иммуноглобулины.
При этом имеются в виду суммарные антитела классов IgG и IgM. После этого острая форма гепатита переходит в хроническую, для которой характерно волнообразное течение с незначительно выраженными симптомами в период обострения. При этом запущенное заболевание способствует развитию цирроза печени, печеночной недостаточности, гепатоцеллюлярной карциномы.
В период хронического течения болезни в крови обнаруживаются иммуноглобулины класса IgG. Показаниями к назначению анализа крови на анти HCV являются следующие состояния: наличие симптомов вирусного гепатита С — ломота в теле, тошнота, отсутствие аппетита, снижение веса, возможна желтуха; повышение уровня содержания печеночных трансаминаз; перенесенный гепатит неустановленной этиологии; обследование пациентов из группы риска по инфицированию вирусным гепатитом С; скрининговые обследования. Результат данного исследования крови может быть положительным или отрицательным.
Рассмотрим, что это — анализ крови на HCV положительный? Такой результат может указывать на вирусный гепатит С острого или хронического течения либо на ранее перенесенное заболевание. Отрицательный результат данного анализа свидетельствует об отсутствии вируса гепатита С в организме.
Тестирование и диагностика Ввиду того, что первичная инфекция ВГС чаще всего протекает бессимптомно, в первое время после заражения у большинства инфицированных она не диагностируется. У пациентов с хронической инфекцией ВГС она также часто не диагностируется, поскольку болезнь протекает бессимптомно в течение десятилетий вплоть до развития вторичных симптомов, связанных с серьезным поражением печени. Диагностика инфицирования ВГС проводится в два этапа: Для выявления лиц с вирусной инфекцией выполняется серологическое исследование на антитела к ВГС.
У таких пациентов даже при отсутствии инфекции результат исследования на антитела к ВГС будет положительным Тест на наличие РНК ВГС может быть выполнен в лаборатории или с помощью простого аппарата в клинике. Новые инновационные пробы, например на коровый антиген ВГС, находятся в стадии экспериментального тестирования и позволят в будущем проводить одноэтапную диагностику активной инфекции гепатита С. В случае диагностирования хронической инфекции ВГС пациента необходимо обследовать для определения степени поражения печени фиброз и цирроз печени.
Это можно сделать с помощью биопсии печени или различных неинвазивных тестов. Решение относительно методов лечения и ведения пациента принимается на основе данных о степени поражения печени. Ранняя диагностика позволяет предотвратить развитие осложнений, связанных с инфекцией, и дальнейшую передачу вируса.
ВОЗ рекомендует проводить тестирование лиц в группах повышенного риска инфицирования. ВОЗ рекомендует, чтобы все взрослые имели доступ к тестированию на ВГС и имели возможность его проведения в сочетании с получением услуг по профилактике, оказанию помощи и лечению. Во всем мире хронические заболевания печени являются одной из основных причин заболеваемости и смертности среди людей, живущих с ВИЧ.
Как выполняется анализ Для выявления антител к гепатиту С используется венозная кровь: Анализ удобен тем, что не требует специальной подготовки. Его сдают в утреннее время натощак. Кровь доставляется в лабораторию в чистой пробирке, после чего обрабатывается иммуноферментным методом.
После образования пар «антиген — антитело» обнаруживаются те или иные иммуноглобулины. Такой анализ является первым этапом диагностики гепатита С. Ее проводят при нарушении функций печени, появлении определенных симптомов, изменении состава крови, планировании и ведении беременности, подготовке к хирургическим вмешательствам.
Антитела к вирусному гепатиту С чаще всего обнаруживаются случайно. Человека этот диагноз всегда шокирует. Однако не стоит впадать в панику, в некоторых случаях анализ оказывается ложноположительным.
При выявлении антител к гепатиту необходимо и начать дальнейшее обследование. Возможные показания для проведения HCV анализа Для прохождения исследования на предмет наличия гепатита С, не нужны разрешения или направления от лечащего врача, на сегодняшний день существует масса лабораторий и медицинских центров, где любой желающий может пройти HCV анализ крови. Тем не менее, существует перечень состояний, которые являются показанием к проведению данного исследования, к ним относят: Желание стать донором.
Наличие в анамнезе жизни заменного переливания крови или ее компонентов. Исключение гепатита С при наличии его вторичных признаков. Выяснение эффективности лечения гепатита С.
Иногда даже при высокой концентрации вирусов в крови пациента, печень оказывается поврежденной лишь в незначительной степени. Однако если у беременной женщины высокий уровень вирусной нагрузки, то велика вероятность передать заболевание своему ребёнку. Считается, что нижняя норма концентрации РНК-вируса — до 600. Генотипирование Из-за того, что этот вирус подвержен высокой мутации, в ходе исследования очень важно определить, какой конкретно генотип находится в крови человека. Всего существуют 11 генотипов гепатита С и множество их подвидов. Но на территории России распространены всего три: 1, 2 и 3. Генотипирование даёт возможность определить, насколько устойчивым оказался вирус. От этого зависит метод лечения. Все генотипы гепатита С по-разному реагируют на лечение. Кроме того, генотипирование даёт возможность посмотреть, в каком состоянии находится печень больного.
Например, накапливание в печени жира указывает на то, что пациент страдает от 3 генотипа вируса. Анализ крови на данной стадии показывает цифру, которая характеризует генотип. Изредка случается, что определить генотип не получается, и в ответах из лаборатории указано «не типируется». Это означает, что человек страдает от генотипа, нераспространенного в этой географической зоне. Чтобы обнаружить его, придётся сдать анализ еще раз, но с той системой диагностики, которая сможет его распознать.
Подготовка к проведению ПЦР-теста Еще одно немаловажное преимущество ПЦР-анализов — это отсутствие специфической подготовки к проведению тестов. Достаточно следовать стандартным рекомендациям специалиста: Анализ сдается утром натощак. При этом ряд генетических исследований проводится в произвольное время, удобное пациенту. При сдаче анализа по мазку из ротоглотки необходимо выдержать интервал с приемом пищи и воды в 3-4 часа перед тестом. Перед анализом на венерические инфекции необходимо воздержаться от половой активности в течение суток. Перед анализом нельзя использовать никакие противовирусные препараты. Подробную инструкцию по правилам подготовки к каждому анализу вы всегда можете получить у лечащего врача или у консультантов на нашей горячей линии. Как проводится ПЦР-анализ С 1983 года, когда был изобретен данный метод, прошло много времени, и технологии не стоят на месте. Сегодня существует несколько различных методик для проведения ПЦР-теста: С обратной транскрипцией. Самый распространенный способ идентификации известной последовательности РНК, включающий амплификацию, определение патогена и его идентификации среди образцов, хранящихся в научной картотеке. Вложенная ПЦР или «гнездовая» — используется для снижения количества неспецифичных продуктов реакции и имеет две стадии с использованием двух видов праймеров. Изотермические методы — не требуют повторяющихся температурных циклов, менее энергозатратны. Инвертированная ПЦР — применяется, если имеется только короткий фрагмент известной последовательности, но необходимо определить соседние последовательности после вставки ДНК в геном. ПЦР в реальном времени — метод, позволяющий определить не только присутствие целевой нуклеотидной последовательности в образце, но и измерять количество ее копий после каждого цикла амплификации, что дает возможность для проведения тестов с количественным результатом Это далеко не все существующие на сегодняшний день разновидности ПЦР-технологий. Ученые активно развивают эту важную и перспективную область лабораторной диагностики, совершенствуют методы ПЦР, оттачивают техники и изобретают новые подходы. Иногда возможно проведение экстренного теста — его часто используют при оказании срочной медицинской помощи при госпитализации. Тогда срок готовности результата сокращается до считанных часов.
Это можно выполнить при помощи химической реакции. Скажем, из трех миллиардов букв ДНК выделяем только триста, и уже с ними работаем. В пробирке мы можем создать такую функцию, которую можно сравнить с поиском текста в компьютере. Сначала с помощью компьютера в базе данных генома человека мы подбираем две маленькие строчки, между которыми должен располагаться искомый текст. С помощью специального аппарата мы выращиваем нужные цепочки ДНК из последовательности букв нуклеотидов , получаем эти маленькие строчки в виде химического вещества в пробирке, добавляем в неё необходимые реактивы, меняем температуру, и в итоге получаем нужный нам участок генома. Дальше его можно анализировать с помощью разных способов. Как анализ конкретных участков ДНК помогает в лечении онкозаболеваний? Мы постоянно ищем такие участки. Отбираем группу пациентов с похожими заболеваниями, достаточно дорогостоящими методами анализируем всю кодирующую последовательность их геномов и смотрим какие-то закономерности, к примеру, что у этой группы встречается с большей вероятностью какой-то генетический вариант. Дальше мы этот вариант будем проверять на расширенной группе больных и здоровых людей. Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. Если это наследственные раковые синдромы, которые мы ищем, то выделяем ДНК из крови. Также есть тесты на соматические мутации, но здесь уже используется биопсийный материал опухоли, в основном речь идет о выборе терапии, например, таргетных препаратов. Что это значит? Мы находимся только в первой половине этого пути познания и понимания. На самом деле это даже не расшифровка в буквальном смысле, а только прочитывание отдельных букв и слов, в отдельных случаях даже без понимания смысла. Мы понимаем только определенные слова — как последовательность ДНК преобразуется в последовательность белка — это и есть генетический код.