Хромосомный микроматричный анализ экзонного уровня. Анализ на патологии и хромосомные нарушения у плода во время беременности. ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ (ARRAY-CGH) с использованием матрицы со средней плотностью 750 тыс. маркеров. Хромосомный микроматричный анализ при неразвивающейся (замершей) беременности.
Генетические нарушения у человека и методы их выявления
| Опубликованы рекомендации РОМГ по ХМА | Ученые оценили целесообразность проведения хромосомного микроматричного анализа при легких отклонениях во втором триместре. |
| Вы точно человек? | Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) пренатальный на ДНК-микроматрицах низкой плотности (350 000 маркеров) (пуповинная кровь) в Мерке. |
| Генетические нарушения у человека и методы их выявления | Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) -молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров. |
| ХМА пренатальный | Хромосомный микроматричный анализ – технология диагностики причин врожденных пороков развития и умственной отсталости у детей. |
Хромосомный микроматричный анализ
Хромосомный микроматричный анализ представляет собой сложную молекулярную технологию, при которой проводится полногеномная амплификация с последующим анализом. Например, автоматизация анализа цитогенетических препаратов значительно улучшила эффективность работы многих лабораторий, а технология ХМА объединяя тысячи. В 2015 году в Казахстане был внедрен хромосомный микроматричный анализ (ХМА), который является золотым стандартом в постнатальной и в пренатальной диагностике. Полногеномный хромосомный микроматричный анализ В России научились вычислять риск возникновения порока сердца у ребенка ещё на этапе планирования беременности.
Полногеномный хромосомный микроматричный анализ для пренатальной диагностики беременных
ХМА позволяет установить причины хромосомной патологии при наличии недифференцированных синдромов у детей с задержкой психомоторного развития, аутизмом, множественными врожденными пороками развития, аномалиями развития. Многочисленные отзывы о хромосомном микроматричном анализе подтверждают его важную диагностическую ценность. Метод позволяет найти генетические причины проблем у ребенка, когда распространенные и достаточно явные хромосомные нарушения такие, как синдром Дауна отсутствуют. Если по ХМА у уже рожденного ребенка нет отклонений, но при этом присутствуют проблемы в развитии — это дает дополнительные силы и надежду родителям — ведь приобретенные дефекты поддаются корректировке.
Это обследование проводится беременным бесплатно при наличии показаний.
До конца 2021 года запланировано проведение 650 хромосомных микроматричных анализов. Это инвазивный метод, для исследования подойдет любой материал, содержащий ДНК, — ворсина плаценты или жидкость внутри плодных оболочек. Анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы.
Разрешающая способность стандартного ХМА от 200 000 п. При выполнении этого анализа с максимальной точностью исследуются все клинически значимые участки генома. Анализ позволяет установить нарушения в генах с известной клинической значимостью. Это позволяет диагностировать все известные микроделеционные синдромы и синдромы связанные с аутосомно-доминантными заболеваниями в случае делеции генов. В некоторых случаях, по результатам стандартного ХМА может быть рекомендовано обследование родителей. Стандартный хромосомный микроматричный анализ позволяет определить хромосомную патологию в пренатальном периоде. Для исследования необходимо небольшое количества амниотической жидкости или ворсин хориона, получаемых при инвазивной процедуре. Метод полностью заменяет кариотип и дает возможность определить контаминацию образца материнским материалом, что исключает риск ложноотрицательных результатов. Хромосомный микроматричный анализ таргетный Таргетный хромосомный микроматричный анализ выполняется на микроматрицах имеющих 350 тыс маркеров сосредоточенных в основных клинически значимых участках генома.
Разрешающая способность стандартного ХМА от 100 000 п. Материал для исследования: кровь в пробирке с ЭДТА минимум 2 мл. Подготовка к исследованию: нет. Сложные генетические исследования.
В Башкирии генетики разработали новый метод пренатальной диагностики
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров. ХМА пренатальный (амниотическая жидкость/ворсины хориона/пуповинная кровь с ЭДТА; выявление хромосомной патологии: анеуплоидии, делеции, дупликации; заключение врача. Хромосомный микроматричный анализ представляет собой сложную молекулярную технологию, при которой проводится полногеномная амплификация с последующим анализом. ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОКАЗАНИЯ • Высокий риск ХП по результатам НИПТ • Ребенок с хромосомной патологией в.
Хромосомный микроматричный анализ - новые возможности - вебинар по ХМА от Геномед
При разрешающей способности в 800 раз превышающий классический анализ кариотипа, хромосомный микроматричный анализ обладает и такими преимуществами, как быстрота выполнения исследования из-за отсутствия необходимости культивирования материала, определение контаминации материнскими клетками и возможность определять однородительские дисомии. Использование новой платформы для пренатальной диагностики повышает эффективность исследования, позволяя, помимо хромосомных аномалий, определять частые и тяжелые рецессивные и доминантные заболевания у плода. Молекулярное кариотипирование абортивного материала. ХМА является лучшим тестом для поиска причин неразвивающейся беременности, самопроизвольного выкидыша, мертворождения. Возможность выявления мутаций, связанных с аутосомно-рецессивными и аутосомно-доминантными заболеваниями, позволяет определить более точный прогноз при планировании следующей беременности.
И когда врачи заранее знают о них, у них появляется больше возможностей помочь. Также в Минздраве РБ заявили, что наша республика - единственный регион в России, где такое обследование по показаниям проводится беременным бесплатно за счет республиканского бюджета. Автор:Виктория Овчинникова.
Хромосомный микроматричный анализ при выкидыше или замершей беременности Хромосомный микроматричный анализ при выкидыше или замершей беременности Одной из частых причин спонтанного прерывания или неразвивающейся беременности, а также множественных пороков развития у плода являются хромосомные аномалии. При этом нарушение хромосомного набора может быть представлено изменением количества хромосом например, отсутствие одной из хромосом или, наоборот, появление в кариотипе дополнительной хромосомы или нарушением их структуры например, за счет вставки дупликации или потери делеции определённого участка хромосомы.
Для подтверждения или исключения подобной причины выкидыша или неразвивающейся беременности необходимо провести хромосомный анализ абортивного материала.
На УЗИ смотрят воротниковую зону, носовую кость, кровоток. У меня носовую кость на тринадцатой неделе не обнаружили и отправили в ЦПСИР переделать через неделю. Через неделю кость также не увидели. Все другие показатели были в норме.
Меня отправили к генетику тут же в соседний кабинет. Генетик очень сухим языком еще раз повторила цифры и рекомендовала сделать амниоцентез, то есть анализ, когда иглой берется амниотическая жидкость и считают хромосомы. На более ранних сроках, 9-13 недель, делают биопсию хориона, но я уже не успевала. На более позднем — после 22 недель — кардоцентез, когда берут кровь из пуповины ребенка. Что я поняла уже постфактум: после 35 лет коэффициент риска с каждым годом сильно возрастает.
То есть в мои 40 лет он уже 1:75 просто априори без анализов и УЗИ. А в 48 лет он будет гораздо больше. При норме УЗИ на чуть повышенный хгч никто бы не обратил внимания, но 40 лет, отсутствие носовой кости и 2,7 вместо 2,5 моль в итоге превратились в риск 1:4. Я сделала неинвазивный тест — сдала анализ крови Пренетикс на определение распространенных хромосомных аномалий. Результат пришел отрицательный.
Я решила не делать амниоцентез, хотя сдала все анализы и была готова. На следующий день мы улетали, а это все-таки маленькая операция, рекомендуется покой и есть небольшая, но угроза выкидыша.
Хромосомный микроматричный анализ при неразвивающейся (замершей) беременности
Анализ может быть проведен даже в том случае, если беременность замерла давно и живых клеток в материале не осталось. Показания: Невынашивание беременности наблюдалось более, чем один раз; Невынашивание беременности произошло впервые, но у семейной пары есть желание выяснить возможную генетические причину; Во время прошлых беременностей у плода были выявлены множественные пороки развития; В семье есть ребенок с хромосомной патологией.
Для исследования необходимо небольшое количества амниотической жидкости или ворсин хориона, получаемых при инвазивной процедуре. Метод полностью заменяет кариотип и дает возможность определить контаминацию образца материнским материалом, что исключает риск ложноотрицательных результатов. Хромосомный микроматричный анализ таргетный Таргетный хромосомный микроматричный анализ выполняется на микроматрицах имеющих 350 тыс маркеров сосредоточенных в основных клинически значимых участках генома.
Разрешающая способность таргетного ХМА от 1 000 000 п. Этот анализ рекомендуется для диагностики специфических синдромов, когда необходимо их лабораторное подтверждение. Таргетный хромосомный микроматричный анализ является информативным для выявления причин потери беременности замершая беременность, спонтанные аборты, прерывание беременности по медицинским показаниям. При этом могут быть выявлены анеуплоидии, структурные перестройки от 1 000 000 п. Таргетный ХМА позволяет определить происхождение дополнительного набора хромосом при триплоидиях и дифференцировать доброкачественную дигиническую триплоидию от частичного пузырного заноса.
Таргетный ХМА, также, позволяет диагностировать полный пузырный занос.
Данное молекулярно-цитогенетическое исследование позволяет с высокой точностью детектировать как анеуплоидии то есть видеть количественное изменение хромосомного набора эмбриона, в частности, подтвердить синдром Дауна трисомия 21 , Эдвардса трисомия 18 , Патау трисомия 13 и др. При этом анализируется материал всех 23 пар хромосом в одном исследовании. Методика позволяет проанализировать одномоментно более 250 тяжелых генетических синдромов, которые невозможно выявить стандартным методом кариотипирования.
При разрешающей способности в 800 раз превышающий классический анализ кариотипа, хромосомный микроматричный анализ обладает и такими преимуществами, как быстрота выполнения исследования из-за отсутствия необходимости культивирования материала, определение контаминации материнскими клетками и возможность определять однородительские дисомии. Использование новой платформы для пренатальной диагностики повышает эффективность исследования, позволяя, помимо хромосомных аномалий, определять частые и тяжелые рецессивные и доминантные заболевания у плода. Молекулярное кариотипирование абортивного материала. ХМА является лучшим тестом для поиска причин неразвивающейся беременности, самопроизвольного выкидыша, мертворождения.
Возможность выявления мутаций, связанных с аутосомно-рецессивными и аутосомно-доминантными заболеваниями, позволяет определить более точный прогноз при планировании следующей беременности.
Вся структура генома в одном исследовании. Хромосомный микроматричный анализ
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) является сложной молекулярной технологией, позволяющей провести полногеномную амплификацию с последующим анализом множества. Полногеномный хромосомный микроматричный анализ В России научились вычислять риск возникновения порока сердца у ребенка ещё на этапе планирования беременности. Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявлять анеуплоидии (количественные изменения хромосом), а также вариации числа копий ДНК, такие как делеции. ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОКАЗАНИЯ • Высокий риск ХП по результатам НИПТ • Ребенок с хромосомной патологией в.
Башкирские генетики разработали новый метод пренатальной диагностики
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – технология молекулярно-генетического исследования. Хромосомный микроматричный анализ. Моногенные наследственные заболевания. Покупайте и продавайте, следите за аналитикой и новостями в любой точке мира.
Хромосомный микроматричный анализ (XMA)
Хромосомный микроматричный анализ молекулярно-генетический анализ aCGH при неразвивающейся беременности абортивный материал Оptima Предназначено для диагностики причин неразвивающейся беременности. Позволяет выявить: - дополнительные или недостающие хромосомы анеуплоидии , - полный дополнительный набор хромосом триплодии , дополнительные или отсутствующие части хромосом дупликации и делеции , - две копии хромосомы от одного родителя однородительская дисомия , - контаминацию материнскими клетками.
Для подтверждения или исключения подобной причины выкидыша или неразвивающейся беременности необходимо провести хромосомный анализ абортивного материала. Данное молекулярно-цитогенетическое исследование позволяет с высокой точностью детектировать как анеуплоидии то есть видеть количественное изменение хромосомного набора эмбриона, в частности, подтвердить синдром Дауна трисомия 21 , Эдвардса трисомия 18 , Патау трисомия 13 и др. При этом анализируется материал всех 23 пар хромосом в одном исследовании.
Одной из частых причин спонтанного прерывания или неразвивающейся беременности, а также множественных пороков развития у плода являются хромосомные аномалии. При этом нарушение хромосомного набора может быть представлено изменением количества хромосом например, отсутствие одной из хромосом или, наоборот, появление в кариотипе дополнительной хромосомы или нарушением их структуры например, за счет вставки дупликации или потери делеции определённого участка хромосомы. Для подтверждения или исключения подобной причины выкидыша или неразвивающейся беременности необходимо провести анализ абортивного материала. Анализ может быть проведен даже в том случае, если беременность замерла давно и живых клеток в материале не осталось. Ограничения К ограничениям анализа относится невозможность выявления мозаицизма, полиплоидии, сбалансированных транслокаций, а также микроделеций и микродупликаций за границами разрешающей способности метода.
Желаете узнать больше о преимуществах и ограничениях?
Особенности метода Метод не определяет сбалансированные хромосомные перестройки. Возможно получение результатов неясной клинической значимости. В связи с этим необходимо иметь максимально полную информацию об обследуемых и иногда бывает необходимо проведение дополнительного исследования родственников. Замораживанию не подлежит.
Ткани 100 - 200 мг в физрастворе.
ХМА при неразвивающейся беременности
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА), также известный как arrayCGH, представляет собой диагностический тест, который может обнаруживать клинически значимые крупные. Хромосомный микроматричный анализ в отношении опухоли может использоваться у больных миелодиспластическим синдромом при нормальном кариотипе. Ученые оценили целесообразность проведения хромосомного микроматричного анализа при легких отклонениях во втором триместре.
Подготовка к исследованию
- Возможности хромосомного микроматричного анализа
- неврологИ – Telegram
- Вся структура генома в одном исследовании. Хромосомный микроматричный анализ
- Для чего проводят
- Хромосомный микроматричный анализ (ХМА)
Генетический анализ крови
Почему ХМА лучше стандартного цитогенетического исследования? Хромосомный микроматричный анализ ХМА позволяет диагностировать хромосомные перестройки размером от нескольких тысяч пар оснований до 5 Мb, не видимые в стандартный цитогенетический микроскоп, которые обозначены как вариации числа копий участков ДНК CNV. Клиническое значение CNV определяется размером перестройки, количеством и составом генов, входящих в этот участок, а также ее происхождением. С учетом того, что в области CNV находится несколько генов, при их утрате или удвоении генетической информации развиваются более сложные клинические проявления. Без проведения хромосомного микроматричного анализа портретная фенотипическая, по внешним проявлениям , диагностика большинства микроделеционных и микродупликационных синдромов не представляется возможным. Для чего ещё применяется ХМА? Хромосомный микроматричный анализ ХМА также применяется для диагностики недифференцированных синдромальных форм моногенных заболеваний в случае делеции утраты генов, если пациент имеет сходный с заболеванием клинический фенотип.
Однако с помощью исследования кариотипа можно выявить не все генетические нарушения.
Оно не способно обнаружить такие изменения, как: микроделеции и микродупликации, когда утрачивается или дублируется очень маленький участок хромосомы; болезни обмена, вызванные нарушением последовательности «букв» генетического кода в отдельных генах; митохондриальные заболевания, связанные с нарушениями в генетическом материале митохондрий; низкопроцентный мозаицизм, когда клеток с неправильным кариотипом очень мало; мутации в отдельных генах, которые не приводят к изменению внешнего вида хромосом; эпигенетические расстройства, при которых структура хромосом и генов не меняется, но изменяется их функция. Для получения дополнительной информации, не видимой в световой микроскоп, используют хромосомный микроматричный анализ ХМА. С его помощью можно изучить все клинически значимые участки генома и выявить изменения в количестве и структуре хромосом, а именно микрополомки микроделеции и микродупликации. Во время хромосомного микроматричного анализа применяют технологию полногеномной амплификации и гибридизации фрагментов опытной ДНК с олигонуклеотидами, нанесенными на микроматрицу. Если объяснять простыми словами, то сначала ДНК, которую необходимо изучить, копируют, чтобы увеличить ее количество, а затем смешивают ее со специальными ДНК-микрочипами, которые помогают выявлять различные нарушения. Эта методика позволяет в одном исследовании выявлять делеции и дупликации участков ДНК по всему геному. Разрешающая способность стандартного ХМА от 100 000 пар нуклеотидов — «букв» генетического кода в отдельных регионах от 10 000 п.
С помощью ХМА можно выявлять: изменения числа хромосом; дупликации и делеции, в том числе микродупликации и микроделеции; отсутствие гетерозиготности — утрату одной из двух копий гена. Это явление имеет важное значение в онкологии, при болезнях импринтинга когда активность гена зависит от того, от какого из родителей он получен , аутосомно-рецессивных заболеваниях связанных с рецессивными генами — о них мы поговорим ниже , близкородственных браках; однородительские дисомии, когда в геноме ребенка присутствуют две хромосомы от одного родителя. Однако, как и предыдущий метод, хромосомный микроматричный анализ имеет некоторые ограничения. Он не позволяет выявлять или ограничен в выявлении таких аномалий, как: сбалансированные хромосомные аномалии, когда в хромосомах происходят изменения, которые не приводят к добавлению или утрате генетического материала. Мутации в генах и заболевания, к которым они способны приводить Мутации — это изменения, которые происходят в ДНК как случайным образом, так и под действием разных факторов, например химических веществ, ионизирующих излучений. Они могут затрагивать как отдельные «буквы» генетического кода, так и большие участки генома. Мутации происходят постоянно, и это основной двигатель эволюции.
Чаще всего они бывают нейтральными, то есть ни на что не влияют, не приносят ни вреда, ни пользы. В редких случаях встречаются полезные мутации — они дают организму некоторые преимущества. Также встречаются вредные мутации — из-за них нарушается работа важных белков, наоборот, происходят достаточно часто. Все внешние признаки и особенности работы организма, которые человек получает от родителей, передаются с помощью генов. Это важнейшее свойство всех живых организмов называется наследственностью. В зависимости от того, как проявляются гены в тех или иных признаках, их делят на две большие группы. Доминантные гены.
Выражаясь простым языком, эти гены более «сильные». Если в клетках присутствует хотя бы одна копия такого гена, его признаки проявятся. Рецессивные гены «слабее» доминантных.
Слепота Диабет может повредить кровеносные сосуды сетчатки, что может привести к слепоте. Диабет также увеличивает риск других серьезных заболеваний зрения, таких как катаракта и глаукома. Повреждение стоп Повреждение нервов в стопах или плохой приток крови к стопам увеличивают риск различных инфекций. Они могут в конечном итоге потребовать ампутации пальца ноги, стопы или голени.
Для чего ещё применяется ХМА? Хромосомный микроматричный анализ ХМА также применяется для диагностики недифференцированных синдромальных форм моногенных заболеваний в случае делеции утраты генов, если пациент имеет сходный с заболеванием клинический фенотип.
Аналогично стандартному анализу кариотипа, с помощью ХМА можно выявить хромосомные анеуплоидии у пациента некратное изменение хромосомного набора, связанное с наличием дополнительной или отсутствием целой хромосомы. Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявить участки с потерей гетерозиготности, что актуально при однородительских дисомиях. Каковы ограничения ХМА? Хромосомный микроматричный анализ не выявляет сбалансированные хромосомные транслокации, инверсии, низкоуровневый мозаицизм, точковые мутации, экспансию тринуклеотидных повторов, а также изменения, находящиеся за границей разрешающей способности метода. Интерпретация клинической значимости структурных изменений, выявленных по хромосомному микроматричному анализу, проводится по специализированным базам данных например, OMIM.